FAQをチェックしましょう。グラフの作り方0いつも勉強させて頂いております。使用している語彙が不適切かもしれませんがどうかご容赦頂きたく思います。お忙しいところ畏れ入りますがご教授頂けますと幸いです。細胞Aについて3回分のRNA-seqのデータ、細胞Bについて3回分のRNA-seqのデータがあります。得られたファイルが手元にあります。★質問これらのデータを使って、細胞Aと細胞Bに発現する遺伝子(一種類のみ)のFPKMを比較したグラフを書きたいと考えております。質問が初歩的で大変申し訳ありません。グラフを作るのが適切なことなのかどうか、そしてエラーバーのための値(標準偏差)は?と往生しております。そもそも根本的に間違っていることも覚悟しております。その場合、恥ずかしながらいわゆるスタンダードなグラフ作成方法をご教授頂けますと助かります。お手数をおかけ致しますどうか何卒宜しくお願い致します。Answer:回答順最新支持されている順0質問から大分期間が経っているようなので既に解決されているかもしれませんし、下記情報すでにご存知かもしれませんが、R言語用のパッケージCummeRbundがCufflinks-Cuffdiffの発現量のグラフに最も一般的に使われるものの一つかと思います。plotなどがaraさんの想定されている1遺伝子用のグラフでしょうか。これらの日本語解説としては以下の記事などが詳しいと思います。R/Bioconductor)牧場の朝(RでNGSデータ(RNA-Seqによる発現データ)cuffdiffの結果ファイル群を読み込んでグループごとでも、サンプルごとでもかけるようですね。これで使われているエラーバーを調べたければ、ソース読むのは多少骨が折れますがRでcummeRbundパッケージ読み込んで以下実行すれば内部で使われているggplot2のgeom_boxplotに関する呼び出し箇所が見つかるはずです。getMethod("csBoxplot","CuffData")ソースの辿り方は拙文をご参考までに。回答とコメントただいまベータテスト運用中です。そのために通知無くコンテンツの変更やサービスの停止変更されることがあります。質問するならライフサイエンスQA。