海王の神殿とは海王(うみおう)の神殿とはメルカ島の北部にある神殿です。元々はこの世界を治める大精霊・海王をまつるために建てられた神殿でしたが、今は魔神ベラムーに占領されています。海王の神殿の入口は地上にありますが、実は地下13階まである地中深く伸びている構造をしています。その後、段階的に深い階へと行けるようになります。海王の神殿内は紫色の床の聖域を除いて、徐々に体力が削られてしまう危険なダンジョンです。夢幻の砂時計と呼ばれるアイテムを入手すると、砂時計の砂がすべて落ちきるまでは体力が減らずに行動できます。聖域外にいる間は砂時計の砂が落ち続ける。ファントム(後述)の攻撃を受けると、砂時計の残り時間が30秒減る(*)。黄色のツボを割ると残り時間が少しだけ回復するアイテムが出る(30秒もしくは15秒)。砂時計の砂が落ちきって残り時間がゼロになると、リンクの体力が減る。知恵のみなもとを集めて知恵の精霊のレベルを上げると、ファントムの攻撃を受けた時の減少時間が減る(通常=30秒、Lv1=15秒、Lv2=5秒)。初期段階では砂時計の砂が落ちきるまで10分あります。新たに時の砂を入手することで、持続時間が伸びます(最長で25分)。時間入手方法+2分風の神殿のボスを倒す+2分勇気の神殿のボスを倒す+2分ゴロンの神殿のボスを倒す+2分氷の神殿のボスを倒す+2分ムトーの神殿のボスを倒す+1分サルベージ+1分サルベージ+1分サルベージ+1分サルベージ+1分サルベージファントム海王の神殿内には夢幻騎士ファントムという鎧に身を包んだ強力な魔物が登場します。共通の特徴3種類のファントムが登場しますが、すべてに共通する事柄は以下の通り:「シーワンの剣」では倒せない。背後から弓矢で射ると短時間だけ失神させることができる。決まった場所で見張っているか、特定のルートを巡回警備する。リンクを見つけると、後を追ってくる。聖域にいるリンクのことは認識できない。ファントムは聖域に入ることはできない。音が鳴る床から出る音に反応する。ファントムの攻撃を受けると、夢幻の砂時計の残り時間が減る。小さなカギ/フォース/クリスタルを持ち運べる。