Interesting to see the reasons why preprints have been withdrawn (mostly factual/methodological errors). 

arXive に掲載されたプレプリントの内、14,000件の撤回の内容についての記述です。全体では約0.5%のようです。学術誌に掲載された後で撤回になるのはデータねつ造や盗用等の不正によるものが多いのに対し、プレプリントの場合は方法論的エラー等により著者自身による撤回が多いのだそうです。