Embora a maioria dos timorenses seja católica, a maioria pratica a religião em conjunto com tradições e rituais animistas.
Apenas cerca de 1, 96% da população de Timor Leste é protestante. O maior grupo protestante em Timor Leste é Assembléias de Deus, embora vários grupos religiosos protestantes estejam presentes no país. Esses grupos incluem os batistas, metodistas, presbiterianos, adventistas do sétimo dia e as Testemunhas de Jeová.
Os devotos de uma minoria da comunidade muçulmana deixam uma mesquita depois de oferecer uma oração matinal especial para dar início ao seu festival Eid al-Fitr em Díli, 24 de Outubro de 2006. CANDIDO ALVES / Getty Images
O país também abriga uma pequena população de muçulmanos, a maioria dos quais é sunita. Notavelmente, o primeiro primeiro ministro de Timor Leste, Mari Alkatiri, era muçulmano.
O número de protestantes e muçulmanos em Timor-Leste diminuiu em mais de metade durante a ocupação indonésia, uma vez que a maioria dos membros dos dois grupos religiosos no país apoiaram o governo indonésio. Depois que Timor Leste se tornou independente, muitos protestantes e muçulmanos permaneceram em Timor Ocidental como cidadãos indonésios.