Foi restaurada pelos portugueses em 1645, devida a restauração aos esforços de Valentim Rocio. Por alvará de 1815 teve um juiz de fora. Foi elevada à categoria de cidade por Lei Provincial de 1842. Tem cinco bons templos: a matriz, o convento dos franciscanos, o melhor da província; a Igreja de Nossa Senhora da Corrente; junto ao rio; a de São Gonçalo Garcia e a de Nossa Senhora do Rosário; tem mais uma igreja menor de São Gonçalo do Amarante, e duas capelas, a de Santa Cruz e a de Nossa Senhora da Penha.
Há nesta cidade um hospital de caridade, fundado pelo finado Coronel João Pereira Alves em 3 de fevereiro de 1770 em uma sua casa, junto à igreja de São Gonçalo Garcia, com o patrimônio de doze mil cruzados e oito moradas de casas térreas; os quais bens entregou à Irmandade de São Gonçalo Garcia para administrá-los e ser a zeladora do mesmo hospital; tomou posse judicial dos referidos bens a irmandade no mencionado dia 3 de fevereiro de 1770.
Os dinheiros pôs a Irmandade a juros em diversas mãos desde 1798. Só pode conseguir a autorização régia deste estabelecimento em 1816, por provisão de 14 de agosto do dito ano. Organizou para o governo e a administração do hospital uns estatutos que foram confirmados por provisão régia de 17 de abril de 1820, e por eles regulava-se, sendo a fiscalização do hospital entregue à mesa da Irmandade, nos termos dos mesmos estatutos. Mas como não tivesse a Irmandade compromisso para o seu regulamento interno, regendo-se somente pelos referidos estatutos concernentes ao hospital, o Dr. Juiz de direito José Vieira Rodrigues de Carvalho e Silva[v] falecido, em correição de novembro de 1853, dissolveu-a por um provimento, e nomeou um administrador para a igreja e outro para o hospital, servindo esta sob a inspeção daquele. Em consequência deste provimento, esteve a Irmandade fora da administração até novembro de 1857, em que, por outro provimento do Juiz de Direito Dr. João Quirino Rodrigues da Silva[vi], foi a Irmandade reintegrada no exercício de suas atribuições. Mas, de novo, foi dissolvida pelo atual juiz de direito Dr. Luiz Barbosa Accioli de Brito[vii], em provimento de correição pela mesma falta de compromisso, nomeando administrador do hospital o Capitão Silvestre Domingues da Silva Pimenteira, até que se apresenta a Irmandade com compromisso confirmado.
Atualmente o patrimônio do hospital consiste em dois escravos velhos que se ocupam do serviço do estabelecimento, nove casas, e 13636$345 em títulos; a saber 5.200$000 em apólices da dívida pública na tesouraria de fazenda de Pernambuco; e 8. 435$345 em débitos com hipotecas, de particulares, vencendo juros. Tem mais a quantia de 4.000$, que foram dados: 2.000$ por Sua Majestade o Imperador e 2.000$ pelo Comendador Dr. Joaquim Serapião de Carvalho[viii]. Este dinheiro foi recolhido à Caixa Econômica da mesma cidade por ordem do presidente da província de então, e tendo sido dissolvida a mesma Caixa, ordenou o presidente, Dr. Antônio Alves de Souza Carvalho[ix], fosse o mesmo dinheiro entregue ao administrador das rendas provinciais para ser recolhido à tesouraria provincial, o que teve lugar, sendo a quantia entregue pelos ex-diretores da caixa econômica; e disto foi sabedora a mesa da Irmandade, apenas por um ofício de Sua Excelência nesse sentido. Nada até agora tem lucrado o hospital destes 4.000$ recolhidos à tesouraria provincial, e, o que mais é, nem título lhe passou esta, existindo tão somente o dito ofício do presidente da província em mão do administrador. Por lei geral de 1850 está o hospital autorizado a possuir bens de raiz até 50;000$. Muito convém que se melhore o sistema de administração deste hospital, cujo patrimônio tem servido mais para os ricos, que retêm os dinheiros do estabelecimento, pagando um módico prêmio, do que para os pobres enfermos, para quem ele foi criado.
A Irmandade do Santíssimo Sacramento da mesma cidade possui 17 casas e a fazenda Camurupim, de animais vacum e cavalar, com duas léguas de terra.
É o Penedo cabeça de comarca do mesmo nome, que se compõe dos Termos do Penedo e Traipu. Tem aula de latim e francês, e quatro de primeiras letras, duas para o sexo masculino e duas para o feminino. A mesa de rendas gerais rende anualmente termo médio: 16:000$; a de rendas provinciais 33;000$; a Câmara Municipal 5:000$. A população da cidade chega a 10.000 almas, tem 1.100 casas, todas de telha, entre estas 78 sobrados.
Antigamente quando era o Penedo o único empório das mercadorias do rio, o seu comércio florescia assaz. Os portugueses, que então negociavam ali, fizeram fortuna e deixaram as famílias com riqueza. Depois, com o aumento do comércio do Traipu, Pão de Açúcar e outros lugares do interior, cujas transações comerciais começaram a ser feitas diretamente para a Bahia, decaiu consideravelmente o comércio do Penedo.