As razões para o resgate das águias incluem armadilhas e tiros dos habitantes locais, mas o principal fator a afetar a espécie é a desflorestação. Um casal reprodutor precisa entre 5.000 e 10.000 hectares de área para viver, bem como de árvores altas para nidificar. Ao mesmo tempo, só 35% das florestas das Filipinas permanecem intactas.
A fundação abriga atualmente 33 águias-das-filipinas. Através de tentativas de reprodução, a equipa espera conseguir libertar novas crias na natureza.