A década de 1990 começou com problemas nas relações entre Estados Unidos e Coreia do Norte. Utilizando imagens feitas por satélites, os norte-americanos descobriram uma nova instalação nuclear no país asiático que, aparentemente, poderia produzir plutônio com finalidade militar. Pressionado, o governo norte-coreano permitiu que inspetores da Agência Internacional de Energia Atômica (AIEA) inspecionassem esta área em 1992. Ainda nesse ano, as duas Coreias assinaram um tratado de desnuclearização, que poderia colocar fim ao medo de Kim Il-Sung utilizar este tipo de armamento. Porém, no ano seguinte, os inspetores da AIEA não puderam verificar o funcionamento e a finalidade de outras duas instalações, o que elevou as tensões e fez com que a Coreia do Norte ameaçasse sair do TNP.
A ameaça, por fim, não se concretizou naquele momento, mas o presidente norte-americano Bill Clinton mandou uma mensagem aos norte-coreanos que, caso fosse descoberta a produção de elementos radioativos para fins militares, levaria a uma ação militar por parte dos Estados Unidos.