A segunda batalha naval que terminou em uma vitória israelense decisivo foi a Batalha de Baltim, que teve lugar em outubro 8-09 fora da costa de Baltim e Damietta. Seis barcos de mísseis israelenses dirigem para Port Said encontrou quatro barcos de mísseis egípcias vindos de Alexandria . Em um compromisso com duração de aproximadamente 40 minutos, os israelenses evadido egípcias mísseis Styx usando contramedidas eletrônicas e afundou três dos barcos de mísseis egípcias com mísseis Gabriel e tiros. As batalhas de Latakia e Baltim "mudou drasticamente a situação operacional no mar a vantagem israelense".
Cinco noites após a Batalha de Baltim, cinco barcos de patrulha israelense entrou na ancoragem egípcio em Ras Ghareb, onde mais de cinqüenta egípcio pequenas embarcações de patrulha, incluindo barcos de pesca armadas mobilizadas para o esforço de guerra que carregado com tropas, munição e suprimentos rumo ao lado israelense do Golfo, foram baseadas. Na batalha que se seguiu, 19 barcos egípcios foram afundados, enquanto outros permaneceram engarrafada no porto.
A Marinha israelense tinha o controle do Golfo de Suez durante a guerra, que tornou possível a implantação continuada de uma bateria SAM israelense perto de uma base naval israelense perto do extremo sul do Canal de Suez, privando o Terceiro Exército egípcio de apoio aéreo e prevenção que ele se mova em direção ao sul e tentando capturar o sul do Sinai.
Comandos israelenses de Shayetet 13, unidade especial de elite da Marinha israelense, se infiltraram no porto egípcio de Arkada na noite de 09-10 outubro e afundou um barco de mísseis de classe Kumar após quatro tentativas anteriores haviam falhado. Depois de mais uma tentativa de infiltração falhou, os comandos infiltrados com sucesso Arkada novamente na noite de 21-22 outubro e fortemente danificada um barco com mísseis M72 LAW foguetes. Durante um dos ataques, os comandos também explodiu principal cais de ancoragem do porto. Em 16 de Outubro, Shayetet 13 comandos infiltrados Port Said em dois mini-submarinos Hazir para atacar alvos navais egípcias. Durante a invasão, os comandos afundou um barco de torpedo, um barco da guarda costeira, um navio de desembarque do tanque, e um barco de mísseis. Dois mergulhadores desapareceram durante a operação. Em 18 de outubro, frogmen israelenses desencadeou uma explosão que rompeu dois cabos de comunicações submarinos ao largo de Beirute , um dos quais levou a Alexandria ea outra para Marselha . Como resultado, telex e de telecomunicações entre o Ocidente ea Síria foram cortados, e não foram restaurados até que os cabos foram reparado em 27 de outubro Os cabos também havia sido usada pelos sírios e egípcios para se comunicar uns com os outros em preferência ao uso de rádio, que foi monitorado por Israel, EUA e inteligência soviética. Egito e Síria recorreu a comunicar através de uma estação de rádio da Jordânia em Ajloun, saltando os sinais de fora de um satélite norte-americano.