O pontífice, que aterrissou em um avião da companhia jordaniana Air Jordan com uma bandeira israelense e outra do Vaticano na cabina, escutou, ladeado por Peres e Netanyahu, o hino nacional do Vaticano, o de Israel e a canção hebréia "Jerusalém de Ouro".Em seu discurso de boas-vindas, Peres assinalou que a visita do papa a Israel é uma missão espiritual da mais alta ordem, uma missão de paz, para "plantar sementes de tolerância e erradicar as más ervas do fanatismo".