A palavra deriva de Cercuaria que foi retirada do latim quercus (carvalho). Ao que parece, sua origem teria algo relacionado a uma cerca feita de carvalhos. Este seria onde residia o fundador da família. Há documentos reconhecendo Cerqueira no século XII, que antes foi registrado como Cercaria.
O primeiro solar a ser conhecido dos Cerqueira é a Torre de Camposa, localizada na Freguesia do Vale, em Portugual.
Das informações encontradas, afirma-se que a família Cerqueira está entre as mais antigas e nobres de Portugual.