Fundada em 1957, tendo início de suas atividades em 1958, sendo denominada como ESCOLA ISOLADA DE GUARAITUBA. Levando o nome de um dos primeiros bairros do município de Colombo, onde se localiza. A primeira sala de aula foi construída em 1957. Ao lado, foi construída uma casa com quatro peças na qual veio morar a primeira professora da escola, Sra. Alda Milani da Silva. No primeiro ano de funcionamento a escola funcionou com apenas uma sala, atendendo a 63 alunos da primeira série. Não havia livros de chamada, nem qualquer tipo de registro.
Os alunos vinham do Atuba, Alto Maracanã, parte da Colônia Faria e Roseira. Nesta época a sala também serviu como igreja, sendo sala de catequese no sábado a tarde e local para a realização das missas no domingo pela manhã. A primeira inspetora se chamava Rosália Vernália e permaneceu na escola até 1959. Entre os primeiros alunos encontramos os Senhores: João Dalprá (Vereador, Vice-prefeito e Prefeito do Município de Colombo), Carmem Dugonski, Adair Santos e Sandra Casero. Em 1962, foi construída mais uma sala de aula, no entanto as dificuldades continuaram, as salas eram multi-seriadas e atendiam a todos os alunos, inclusive os com necessidades especiais.A ampliação da escola foi iniciada após o Cônsul Português Senhor Joaquim Ferreira Gomes doar a comunidade um terreno próximo a BR 476 (Estrada da Ribeira).
A construção teve início pela ação dos Senhores Tadeu Subchinski (Deputado Estadual) e Raulino Costacurta (da Prefeitura Municipal de Colombo). A primeira denominação da escola foi "Escola Isolada de Guaraituba". Em 1982, a escola contava com 6 salas de aula, mas o número era insuficiente e a escola teve que funcionar em três turnos para atender aos cerca de 400 alunos matriculados. Em 30 de dezembro de 1982, o Decreto Estadual n.° 3.739/82 dá à escola a denominação de Escola Estadual de Guaraituba.
A Escola funcionou atendendo de 1.ª a 4.ª séries até 1984, e então a partir de 1985 foi autorizada pelas Resoluções n.° 3.772 de 13 de junho de 1984 e n.° 8.234 de 12 de dezembro 1984, a implantação gradativa de 5.ª a 8.ª série do primeiro grau. Em 1988 nossa escola terminou a implantação do ensino fundamental.
Nos anos seguintes ocorreram mais mudanças, materialmente foram construídas de mais salas, biblioteca, entre outras melhorias. Com a municipalização do ensino de educação infantil e series iniciais através do Decreto n.° 591 de 05 de março de 1991, ocorre à separação entre as etapas de escolarização, sendo as séries iniciais do Ensino Fundamental assumidas pela Escola Municipal Ângelo Falavinha Dalprá, a Escola Estadual Guaraituba passa a ofertar apenas o ensino de 5.ª a 8.ª séries do Ensino Fundamental. No ano de 2003, foi construída mais uma sala de aula, totalizando 11 salas (sendo 4 de madeira) que atendem 22 turmas nos turnos manhã e tarde.
A primeira Diretora da Escola foi a Senhora Dirce de Arruda Monteiro que ficou no cargo de sua posse até 1992. De 1993 a 1996 assumiu a Senhora Janete Dalprá Bianchesi, a partir de 1996, assumiu a Senhora Terezinha de Jesus Carneiro Galdino que permanece até a presente data.