Nos últimos anos em que esteve no Exército, Hamilton Mourão envolveu-se em situações controversas. Em 2015, durante palestra no Centro de Preparação de Oficiais da Reserva (CPOR) de Porto Alegre, defendeu “o despertar de uma luta patriótica”. A declaração ocorreu três meses antes da abertura do processo de impeachment contra a então presidente da República, Dilma Rousseff.
Na ocasião, disse ainda que a eventual substituição da petista não alteraria o “status quo” e a mudança seria “o descarte da incompetência, má gestão e corrupção”.
As declarações de Mourão não foram bem recebidas em Brasília. Ele foi exonerado do CMS. Bolsonaro acompanhou a cerimônia de despedida do general no órgão. Mourão foi, então, designado para a Secretaria de Economia e Finanças do Exército.
Ainda no Rio Grande do Sul, Mourão permitiu a realização de uma homenagem póstuma ao coronel Carlos Alberto Brilhante Ustra, ex-comandante do DOI-Codi de São Paulo, um dos principais centros de repressão da ditadura militar. O evento ocorreu no pátio da 6ª Brigada de Infantaria Blindada, em Santa Maria (RS).
Em setembro de 2017, durante palestra promovida pela maçonaria em Brasília, o general afirmou: seus “companheiros do Alto Comando do Exército” entendiam que uma intervenção militar poderia ser adotada caso o Judiciário não solucionasse o “problema político” do país.
“Até chegar o momento em que as instituições solucionem o problema político, pela ação do Judiciário, retirando da vida pública esses elementos envolvidos em todos os ilícitos, ou então nós teremos que impor isso. […] Se tiver que haver, haverá [ação militar]. Hoje, nós consideramos que as aproximações sucessivas terão que ser feitas”
Em dezembro de 2017, Mourão foi destituído da secretaria após afirmar que o presidente Michel Temer fazia do governo um “balcão de negócios” para se manter no poder. As falas do general ocorreram em meio a mais uma defesa de intervenção militar.
Hamilton Mourão deixou oficialmente o Exército em fevereiro de 2018. Desde então, mergulhou na política. A chegada de Mourão ao PRTB alimentou a expectativa de que ele fosse lançado candidato à Presidência da República. A candidatura do general, no entanto, foi vista como um entrave para as pretensões de Jair Bolsonaro. Aliados, eles rachariam os votos do eleitorado conservador do país, o que poderia interferir no desempenho de ambos.
Com o cenário indefinido, Fidelix assumiu a pré-candidatura pelo PRTB. Mas, após semanas de negociações, o partido fechou aliança com Bolsonaro e colocou Mourão como vice da chapa encabeçada pelo capitão da reserva.
Hamilton Mourão não foi a primeira opção de Jair Bolsonaro para vice-presidente. Antes, a campanha do ex-capitão cogitou diversos nomes, como: o senador Magno Malta (PR-ES); o também general do Exército Augusto Heleno (PRP); a advogada Janaína Paschoal (PSL), uma das autoras do pedido de impeachment contra Dilma Rousseff; o astronauta Marcos Pontes, o primeiro brasileiro a participar de uma missão ao espaço; e do príncipe Luiz Philippe de Orleans e Bragança (PSL).
“Eu deixo de ser capitão. Mourão deixa de ser general. Nós passamos a ser, a partir de agora, soldados do nosso Brasil”
Um dia depois de ser alçado candidato a vice-presidente da República, Mourão declarou que o povo brasileiro tem a “malandragem” e a “indolência” como heranças dos negros e dos indígenas. “[No Brasil] Ainda existe o famoso ‘complexo de vira-lata’, infelizmente. […] Essa herança do privilégio é ibérica. Temos uma certa herança da indolência, que vem da cultura indígena. Eu sou indígena. Meu pai é amazonense. E a malandragem. Nada contra, mas a malandragem é oriunda do africano. Então, esse é o nosso ‘cadinho’ cultural.”