Esta Lagoa foi classificada como reserva natural pelo Governo Regional dos Açores, principalmente pela existência das amêijoas no local e para protegê-las de extinção. Existe muito interesse comercial nesta espécie de amêijoas, sendo a única explorada comercialmente nos Açores.
A amêijoa ruditapes decussatus, é uma espécie protegida e por isso existe um período de defeso, onde há uma interdição para conservar a espécie. O período de defeso acontece de 15 de maio a 15 de agosto. Os comerciantes normalmente compram-nas antes e mantêm-nas congeladas para comercializá-la na época alta.