No ano de 2002, aindaem decorrência da criação do Ministério da Defesa, o Comando da Aeronáutica organizou uma comissão para reestruturar a FAB. Entre as inovações contidas no plano de reestruturação esteve a portaria que permitiu a entrada de mulheres no posto de cadete aviador. Em abril de 2005, seguindo o planejamento anteriormente citado, foi publicada a nova Doutrina Básica da Força Aérea Brasileira do Comando da Aeronáutica, na qual ficou exposto que entre as atribuições da FAB deveria estar o controle do espaço aéreo brasileiro, levando-a a atuar não apenas no campo militar, mas também, no controle da aviação comercial, de acordo com as "atribuições subsidiárias"que lhe foram imputadas pela Lei Complementar nº 97 de 9 de junho de 1999. Em decorrência destas alterações surgiu, por intermédio da Lei Nº 11.182, de 27 de setembro de 2005, a Agência Nacional de Aviação Civil (ANAC).
FONTES: BANDEIRA, M. Estado nacional; Estado de S. Paulo(1986 a 1995); Folha de S. Paulo (1988 a 1995); Globo (1986 a 1998); Jornal do Brasil (1988 a 1995); LAVENÈRE WANDERLEY, N. História; LIMA, R. Senta; MIN. AERONÁUTICA. Internet; SOUSA, J. Ministros; Veja (1973 a 1998).