Apesar da esmagadora vitória britânica na batalha, a campanha tem sido considerada um triunfo estratégico para França. O historiador Edward Ingram defende que, se Nelson tivesse interceptado Napoleão no mar, como ordenado, a batalha que se seguiria poderia ter aniquilado tanto a frota francesa, como os navios de transporte. Na realidade, Napoleão pôde continuar a guerra no Médio Oriente e, mais tarde, regressar à Europa ileso.[196] A potencial mudança no rumo da história é ainda mais marcante quando se observa a lista de oficiais do exército franceses que fizeram parte da campanha do Mediterrâneo que, mais tarde, formariam a elite dos generais e marechais do império de Napoleão. Para além do general francês, estiveram presentes: Louis-Alexandre Berthier, Auguste de Marmont, Jean Lannes, Joachim Murat, Louis Desaix, Jean Reynier, Antoine-François Andréossy, Jean-Andoche Junot, Louis Nicolas Davout e Mathieu Dumas.[197]
A Batalha do Nilo continua a ser uma das vitórias mais famosas da Marinha Real,[198] e a fazer parte do imaginário popular britânico, representada por cartoons, pinturas, poemas e peças de teatro.[199] Um dos poemas mais conhecidos sobre a batalha é Casabianca, escrito por Felicia Dorothea Hemans, em 1826, o qual descreve um relato romanceado da morte do filho do capitão Casabianca no Orient.[200] Foram erigidos monumentos, destacando-se a Agulha de Cleópatra, em Londres. Este monumento foi oferecido por Mehmet Ali, vice-rei do Egipto, em 1819, pelo reconhecimento da batalha de 1798 e pela campanha de 1801, mas só foi erigida em Victoria Embankment em 1878.[201] Outro memorial, o Arvoredo do Nilo, perto de Amesbury, um conjunto de faias supostamente plantadas por Lorde Queensbury, pelo legado de Lady Hamilton e Thomas Hardy após a morte de Nelson.[202] As árvores têm a forma do plano de batalha; cada conjunto representa a posição de um navio britânico ou francês.[203] Um memorial semelhante terá sido plantado perto de Alnwick pelo agente de Nelson, Alexander Davison.[202] Na Marinha Real, a batalha é comemorada pelos nomes dos navios HMS Aboukir e HMS Nile e, em 1998, o 200.º aniversário da batalha foi celebrado com uma visita à baía de Abukir pela fragata HMS Somerset, cuja tripulação colocou coroas de flores em memória daqueles que perderam as suas vidas na batalha.[204]