O território é administrado a partir da Capitania da Guatemala, mas o seu afastamento e falta de mão de obra local são de que a Costa Rica vai crescer mais lentamente.
Em 1717 a cidade de Heredia é baseado. San Jose virá vinte anos mais tarde, em 1737, depois em 1782 Alajuela aparecer.
A população indígena é praticamente dizimados por doenças européias, e os colonos não são ricos o suficiente para trazer escravos negros, com algumas centenas de Jamaica.
Isolado da vida latino-americana e do tempo da coroa espanhola, a Costa Rica não foi sequer entregue guerra de independência.