Bolsa 13/22136-1 - Epidemiologia, Metagenômica - BV FAPESP
Aplicação de metagenômica para descoberta de novos vírus na Mata Atlântica paulista
Processo: 13/22136-1
Auxílio(s) vinculado(s): 18/02055-0 - A adaptação ao uso de codões vertebrados se relaciona com o potencial de emergência do Flavivirus?, PUB.ART 18/02056-7 - Sequência Genoma Completa de um Metapneumovírus Humano Isolado coletado no Brasil, PUB.ART 18/01768-3 - Seqüências completas do genoma de cinco isolados de vírus sincicial respiratório humano coletados no Brasil, PUB.ART 17/24004-6 - Seqüências completas do genoma de dois Vírus da Parainfluenza Humana Tipo 3 Isolados coletados no Brasil, PUB.ART
Assunto(s): Epidemiologia Metagenômica Sequenciamento de alta performance Zoonoses
Abordagens metagenômicas têm possibilitado a descoberta de uma variedade de vírus previamente desconhecidos no meio ambiente e nas populações humanas. No Brasil, a fragmentação e a invasão de áreas florestas tropicais têm aumentado exponencialmente as chances da exposição humana a vírus exóticos e novas zoonoses. A Mata Atlântica presente no Atlântico-Sul margeia pequenas áreas de populações humanas que possuem acesso às metrópoles densamente populadas e portos marítimos. Dado o grande potencial de espalhamento viral, este projeto tem como objetivo coletar amostras de soro em áreas geográficas que apresentam este perfil de maior contato com regiões tropicais próximas a metrópoles. Objetivamos identificar novos vírus utilizando (I) uma abordagem de sequenciamento de alta performance (sequenciamento de segunda geração) e (II) análise in silico dos perfis do modelo de Markov. Ao final, esperamos caracterizar possíveis novas espécies virais e cultivá-las em linhagens celulares a fim de determinar a prevalência da infecção humana por meio sorologia. (AU)
DI PAOLA, NICHOLAS; DE MELO FREIRE, CAIO CESAR; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO. Does adaptation to vertebrate codon usage relate to flavivirus emergence potential?. PLoS One, v. 13, n. 1 JAN 31 2018. Citações Web of Science: 4.
PAOLA, Nicholas Di. Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais.. 2018. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas São Paulo.