Auxílio à pesquisa 10/18198-3 - Genômica, Proteômica - BV FAPESP
Processo: 10/18198-3
Vigência: 15 de janeiro de 2011 - 14 de janeiro de 2012
Pesquisador visitante: Rolf Alexander Prade
Assunto(s): Genômica Proteômica Bagaço de cana-de-açúcar Bioetanol Biodegradação Intercâmbio de pesquisadores
Bagaço de cana assim como outras fontes de biomassa tais como milho e sorgo são produzidas em grandes quantidades por usinas alcooleiras e biorefinarias. A utilização da biomassa como fonte de açúcares fermentáveis (obtido pela degradação da celulose e hemicelulose) viabilizando a produção de bicombustíveis de segunda geração, é um item prioritário nos programas de bioenergia de muitas nações. Na natureza biomassa morta é inteiramente reciclada por complexas interações de sistemas microbianos. Isso significa que os polímeros recalcitrantes são decompostos em suas unidades monoméricas (açúcares e fenóis) e utilizados pelos microrganismos para promover o crescimento vegetativo, produzindo CO2 e H2O. A nossa hipótese diz que o processo natural de reciclagem integral da biomassa requer um sistema enzimático, em vez de enzimas individuais. Portanto a nossa proposta sugere entender este sistema enzimático da natureza, determinar a sua base genética e reconstruir este sistema enzimático em um sistema heterólogo apto para produção comercial destas proteínas. O projeto Biologia de Sistemas das Interações microbianas na Decomposição do Bagaço de cana é uma colaboração entre a Oklahoma State University e o CTBE e faz interface com projetos em biomassa de sorgo, milho financiados pelos Departamentos de Energia (Contrato ZDJ-7-77608-01) e Agricultura (contrato 2007-35504-18244) dos Estados Unidos e a companhia Edenspace Corp. (contrato 06103-OKL) e o projeto "Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome" (Investigator Principal: Fabio Squina), financiado pelo programa BIOEN da FAPESP (Processo: 2008/58037-9). (AU)
MANDELLI, F.; COUGER, M. B.; PAIXAO, D. A. A.; MACHADO, C. B.; CARNIELLI, C. M.; ARICETTI, J. A.; POLIKARPOV, I.; PRADE, R.; CALDANA, C.; PAES LEME, A. F.; MERCADANTE, A. Z.; RIANO-PACHON, D. M.; SQUINA, FABIO MARCIO. Thermal adaptation strategies of the extremophile bacterium Thermus filiformis based on multi-omics analysis. EXTREMOPHILES, v. 21, n. 4, p. 775-788, JUL 2017. Citações Web of Science: 7.
SEGATO, FERNANDO; DAMASIO, ANDRE R. L.; GONCALVES, THIAGO A.; DE LUCAS, ROSYMAR C.; SQUINA, FABIO M.; DECKER, STEPHEN R.; PRADE, ROLF A. High-yield secretion of multiple client proteins in Aspergillus. Enzyme and Microbial Technology, v. 51, n. 2, p. 100-106, JUL 15 2012. Citações Web of Science: 37.
SEGATO, FERNANDO; DAMASIO, ANDRE R. L.; GONCALVES, THIAGO AUGUSTO; MURAKAMI, MARIO T.; SQUINA, FABIO M.; POLIZELI, MARIA DE LOURDES T. M.; MORT, ANDREW J.; PRADE, ROLF A. Two structurally discrete GH7-cellobiohydrolases compete for the same cellulosic substrate fiber. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 5, APR 11 2012. Citações Web of Science: 12.