A ATAM é constituída por Assembleia Geral, enquanto órgão deliberativo; Direção, como órgão de administração ou execução e Conselho Fiscal, com capacidade própria de fiscalização.
A ATAM desenvolve a sua atividade, de forma descentralizada, através de 16 delegados distritais e dois delegados regionais, que a representam nas respetivas áreas geográficas.