O Cebreiro também tem seu milagre, ocorrido no ano 1300, conhecido como o Milagre da Eucaristia ou a Lenda do Santo Graal da Galícia. Juan Santín – que vivia no povoado de Barxamaior, distante meia légua de O Cebreiro – era tão devoto que não cessava de ir à missa, mesmo com chuva, vento ou frio. Num dia de furiosa tormenta, o pároco pensou que ninguém viria à igreja e viu apenas um único fiel, Juan, aguardando pela missa. Com desdém, o padre disse a si mesmo: “Este vem, apesar da tempestade e da fadiga para ver um pouco de pão e vinho”. Deus, para repreender-lhe a falta de fé e de caridade, realizou o milagre de converter a hóstia em carne e o vinho em sangue, no momento da consagração, para assombro e testemunho do próprio padre e do piedoso Juan Santín.
A rainha Isabel, a Católica, ao regressar de sua peregrinação em 1488, tentou levar o cálice para um lugar mais seguro, porém os cavalos da carruagem real negaram-se a continuar a viagem. Em resposta ao que pareceu ser um sinal divino, a rainha doou o relicário no qual se conserva o cálice do milagre, uma bela obra do século XII. No entanto, em anos recentes, o cálice deixou de ser exposto, devido aos constantes roubos de arte sacra nas pequenas e desprotegidas igrejas do interior espanhol.