Não está havendo transmissão nas cidades, porém todas as regiões do país possuem áreas (zonas rurais, regiões de cerrado, florestas) onde há risco de transmissão da febre amarela. Nestas áreas, a infecção é transmitida por mosquitos do gênero Haemagogus (principalmente) e o ciclo do vírus é mantido através da infecção de macacos e da transmissão transovariana no próprio mosquito. O vírus da febre amarela circula em todos os municípios das regiões Norte, Centro-Oeste (incluindo o Distrito Federal). Também circula em numerosos municípios das regiões Nordeste (no Maranhão, em todos), Sudeste e Sul. Em parte dos municípios dos Estados da Bahia, Minas Gerais e Espiríto Santo embora não esteja ocorrendo circulação viral, existem condições que podem permitir a eventual transmissão da febre amarela.
Centro-Oeste* Goiás (incluindo Brasília - DF), Mato Grosso e Mato Grosso do Sul
Sudeste Espírito Santo, Minas Gerais (todos, incluindo Belo Horizonte) e São Paulo
As manifestações da febre amarela não dependem do local de transmissão. Não existe um tipo de febre amarela "silvestre" e outro "urbano", mas transmissão em áreas silvestres (cerrados, principalmente), transmissão em áreas rurais e transmissão em áreas urbanas. A doença é uma só. A diferença está apenas nos transmissores e no local geográfico de aquisição da infecção.O vírus e a evolução clínica são idênticos.
Esse risco pode ser significativamente reduzido com a vacinação, pelo menos dez dias antes da viagem, de pessoas que se dirigem para áreas de transmissão silvestre e "rural", com o combate efetivo aos Aëdes e com a gradativa e sistemática vacinação das populações urbanas. Além disso, é necessário ampliar a capacidade do sistema de vigilância para torná-lo capaz de detectar em tempo hábil os casos de febre amarela, mesmo os menos exuberantes. O Brasil possui diversos Laboratórios de Referência, capacitados a realizar a confirmação do diagnóstico de febre amarela, inclusive no Rio de Janeiro. A confirmação laboratorial do diagnóstico, em geral, pode ser feita em até 48 horas.