Cabe ao Núcleo de Contabilidade, elaborar as solicitações de transferência de fundos à Entidade Contabilística do Estado; Elaborar os registos dos cabimentos, compromissos e compromissos futuros relativos a encargos plurianuais; Emitir e enviar as faturas aos clientes; Elaborar os mapas da proposta de orçamento anual; Assegurar o controlo da execução orçamental e respetivos processos de alterações ao orçamento; Prestar informação, nos períodos devidos, às instituições a que está legal e estatutariamente obrigada; Disponibilizar ao Conselho de Gestão informação financeira de suporte à decisão; Elaborar as reconciliações bancárias e as sínteses bancárias mensais; Organizar a conta de gerência a submeter ao Tribunal de Contas e demais entidades a que está obrigada; Assegurar a boa conservação e a ordem do arquivo inerente a este Núcleo.