A UISM tem o propósito de coordenar e executar as ações e atividades relacionadas à Saúde Mental na área do Rio de Janeiro, e assim contribuir para a eficácia do Sistema de Saúde da Marinha (SSM). Para a consecução do seu propósito, cabem à UISM as seguintes tarefas:
I – executar a assistência psiquiátrica ambulatorial e hospitalar;
II – coordenar o Programa de Saúde Mental da MB;
III – coordenar as atividades de Psiquiatria de Ligação;
IV – executar, sob a supervisão do HNMD, programas de Estágio, Aperfeiçoamento e Residência Médica e de Enfermagem na área de Saúde Mental;
V – estabelecer intercâmbios com outras instituições ligadas à área de Saúde Mental; e
VI – executar atividades relacionadas com a Psiquiatria Forense.
Em situação de mobilização, conflito, Estado de Defesa, Estado de Sítio, Intervenção Federal e em regimes especiais, cabem à UISM as tarefas que lhe forem atribuídas pelas Normas e Diretrizes referentes à Mobilização Marítima e às emanadas pela Diretoria de Saúde da Marinha.