A paz foi assinada no Tratado de Poncho Verde, em que os farrapos colocaram fim na revolta e, na condição de derrotados, aceitaram os termos propostos pelo governo.
Os provincianos teriam direito de escolher o próprio presidente de província (entretanto, isso não foi cumprido);
Os historiadores sabem atualmente que, ao lado dos farrapos, houve grande participação de escravos e negros libertos. Tal participação ocorreu pela habilidade de muitos deles em funções importantes. No entanto, muitos desses escravos também aderiram à luta dos estancieiros por (falsas) promessas de liberdade que lhes haviam sido feitas.
A revolta realizada pelos farrapos não era um movimento de caráter abolicionista, uma vez que muitos dos estancieiros e charqueadores possuíam uma grande quantidade de trabalhadores escravos, e, portanto, para eles a abolição não era economicamente viável. Havia, sim, farrapos que defendiam o abolicionismo, mas o movimento em si não tinha em sua pauta promover a abolição da escravidão, caso fossem vitoriosos.
Essa questão é elucidada principalmente por Juremir Machado da Silva, que afirma que parte da Guerra dos Farrapos foi financiada com a venda de escravos no Uruguai|3|. Outra grande polêmica que divide a historiografia foi o acontecimento da Batalha de Porongos, em 14 de novembro de 1844.