O Agente 47 foi criado através de engenharia genética para ser a máquina de matar perfeita. É conhecido apenas pelos dois últimos digitos do código de barras tatuado na parte de trás do seu pescoço. Representa o culminar de décadas de investigação, sucede a quarenta e seis outros clones e foi dotado de força, velocidade, resistência e inteligência sem precedentes.
O seu mais recente alvo é uma mega-corporação que pretende desvendar o segredo do passado do Agente 47 de forma a criar um exército de assassinos ainda mais poderosos.
Ao fazer equipa com uma jovem que poderá saber o que é necessário para derrotar os seus inimigos, o Agente 47 vê-se confrontado com a verdade sobre a sua origem enquanto trava uma épica batalha contra o seu mais mortal inimigo.