A GPU Adreno 506 deu conta de executar jogos considerados pesados, como Real Racing 3, sem problemas de performance perceptíveis a jogadores casuais.
O Zenfone 3 tem a personalização do Android chamada ZenUI 3.0. Ela modifica o visual do sistema do Google ao mesmo tempo que dá a ele mais recursos. Os já citados modos de foto são exemplos disso. Mas há muito mais. O foco desses recursos é dar opções ao consumidor que tem intimidade com tecnologia.
O aplicativo da Asus mais interessante presente no Zenfone 3 é o Asus Mobile Manager. Nele, dá para fazer coisas como mudar o modo de gestão de bateria; medir o uso de dados de internet móvel; ver quais apps mandam mais notificações; limpar a memória RAM e gerenciar as permissões de aplicativos.