O Relatório de Gestão é parte integrante do processo de prestação de contas e publicização das ações do Instituto. Mostra o desempenho de todas as atividades desenvolvidas pela instituição relacionadas à Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural, Gestão Administrativa, Financeira e Contábil. O detalhamento das ações realizadas durante o ano pelos diversos programas do Instituto, incluindo o tipo de atividade e de público também são apresentados no documento. São destacados os principais indicadores do Instituto, que revelam, em números, a situação no ano em questão. Recentemente passou a incluir também detalhes da aplicação dos recursos orçamentários e de convênios, entre outros documentos.
O Relatório de Gestão é apresentado anualmente ao Conselho Administrativo – CA, conforme estabelece a Lei Complementar 194, de 2000, que dispõe sobre a obrigatoriedade de apresentação de tal documento.