O clube foi fruto da fusão do São Caetano Esporte Clube e do Comercial de São Paulo, e seu nome e uniforme eram homenagens ao São Bento, clube paulistano campeão estadual em 1914 e 1925.
O clube já nasceu na primeira divisão, devido ao histórico do Comercial da Capital pois o São Caetano estava na segunda divisão.
A experiência, entretanto, não deu certo, e a fusão foi encerrada em 1957, com os dois clubes originais voltando às suas respectivas divisões no ano seguinte. Em 1959, o São Caetano abandonou o futebol profissional (embora o clube exista até hoje) e o Comercial foi rebaixado à segunda divisão. No ano seguinte, desceu à terceira, que disputou em 1961, antes de a equipe ser desativada.
Fonte: Almanaque do Futebol Paulista 2000 de José Jorge Farah Neto e Rodolfo Kussarev Júnior
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