Existem diferentes maneiras de cultivar o kefir, e as duas mais comuns são no leite e na água. No caso do leite kefir, a bebida tem propriedades probióticas, poucas calorias se comparado ao iogurte (com o qual tem um sabor bastante similar), além de ser uma ótima fonte de cálcio e magnésio.
Já o kefir em água é uma opção para aqueles que têm a intolerância à lactose e também pessoas veganas. Apesar disso, é preciso uma atenção ao seu consumo, uma vez que ele não conta com quantidades elevadas de cálcio e magnésio, além de ter um açúcar restante, restringindo o seu uso às pessoas com diabetes.
Desde o seu surgimento, a preparação do kefir foi introduzida de diferentes maneiras entre as pessoas. Isso fez com que as formas de consumo variassem. De maneira geral, o kefir com leite ou água pode ser consumido como uma bebida em sua forma natural.