Basta olhar seus jogos para ver que são todos cheios de referências. Snatcher é Blade Runner, O Exterminador do Futuro e todos aqueles filmes hi-tech dos anos 80. Toda a construção de Snake, protagonista de Metal Gear, também tem inspirações: seu nome mesmo é baseado em Snake Pilssen, de Escape from New York.
Filmes como The Great Escape, Full Metal Jacket e, claro, a série de James Bond são outras inspirações para MGS, assim como Dawn of the Dead – destacado pelo próprio Kojima em um artigo escrito para a PlayStation Magazine. Sem falar nos animes com robôs gigantes, como Akira e Evangelion, em jogos como Zone of Enders.