O método pragmático de combate às doenças, arrancando-as ou expondo-as a substâncias inibidoras, foi então entendido como um extermínio de plantas nocivas que crescem em determinado ambiente. Prática que, aos olhos materialistas, parece ser a mais lógica, porém agora se elucidava perfeitamente os seus insucessos a longo prazo, pois, o seu êxito imediato, por não agir no terreno mórbido, não é capaz de impedir que as mesmas ou outras novas enfermidades reapareçam no mesmo doente, assim como surgiram pela primeira vez. A homeopatia, ao contrário, predispunha-se agora a estudar o terreno que propicia e fomenta o aparecimento das enfermidades humanas, aplicando um estímulo para que essas condições fundamentais fossem modificadas. Assim, esse novo método passou a tratar, na verdade, o ambiente da doença e não esta propriamente. O ato médico deixava, então, de ser um mero extermínio de ervas daninhas para ser uma terapêutica de terreno.
Essa nova e revolucionária medicina que nascia com os fundamentos unicistas da homeopatia fez o médico voltar os seus olhos para a essência humana, o determinante da morbidez do terreno – base sobre a qual se assenta a doença, compreendendo-se o corpo físico como um quimérico campo de efeitos, onde qualquer atuação é irrisória ou meramente paliativa. Dessa forma, doenças iguais passaram a receber tratamentos diferentes e doenças diferentes, tratamentos semelhantes, em decorrência de se fixar a constituição como o alicerce da nova terapêutica – o sujeito visto como um todo, e não em partes isoladas.
E ainda, vislumbrando que a doença é projeção de algo mais profundo e invisível do cosmo orgânico, passou-se a considerá-la não um mal destituído de finalidade, porém uma tentativa de se resolver a adulteração do terreno sobre o qual se assenta. Ou seja, compreendia-se que o meio físico apenas absorve o potencial enfermiço da pestilência energética gerada no campo psíquico do ser. A doença orgânica não seria nada mais do que o reflexo da unidade humana enferma – a satisfação da suscetibilidade mórbida, como a homeopatia passou a vê-la. Em última análise, é sempre um mal menor que visa à defesa do equilíbrio da mente e seus estratos mais sutis. O indivíduo, uma vez doente, tenta localizar esse distúrbio em seus planos superficiais, a fim de consumir nos órgãos menos importantes o potencial enfermiço de suas próprias pulsões negativas.
Estava estabelecido um maravilhoso método que conduzia o raciocínio médico a admitir a existência de domínios imponderáveis na unidade humana que a leva a adoecer. Buscando compreender como a energia vital se enferma, formou-se a base para uma nova corrente de especulações puramente filosóficas, de alto alcance espiritual, chegando-se a uma compreensão mais avançada dos mecanismos eminentemente sutis que levam, em uma última análise, ao adoecimento do homem e seus veículos de manifestação, o energético e o físico. A homeopatia tornou-se, assim, uma filosofia de consequências médicas e penetrou no conhecimento de leis que regem os equilíbrios da vida consciencial, em suas expressões mais profundas. Voltando suas perquirições para o reino das causas, o médico deixou de ser um guerreiro da saúde, combatente dos males que o indivíduo produz para si mesmo, abandonando o chamado “arsenal” médico de ataque, para se converter em um administrador da doença, retirando dela o seu máximo proveito e estimulando processos endógenos de cura para o homem integral.
Ao iniciar o tratamento do doente como um todo e não do órgão enfermo, Hahnemann e seus primeiros seguidores depararam-se com um fato inusitado: os pacientes, sob o estímulo do medicamento dinamizado e aplicado agora segundo a similitude de terreno e não da doença física, voltaram a agravar antes de melhorar. As famosas reações homeopáticas se estabeleceram, suscitando ao médico novos entendimentos do fenômeno mórbido.