Em 22 de abril de 1971, buscando reunificar esses esforços, o Cognae foi extinto, e em seu lugar foi criado o INPE, encarregado das pesquisas espaciais no âmbito civil, ainda vinculado ao CNPq. E foi instituído um ente misto, sob a presidência do Estado Maior das Forças Armadas, a Comissão Brasileira de Atividades Espaciais (Cobae), à qual incumbiria orientar ambos os ramos da pesquisa espacial: o civil, do INPE, e o militar, subordinado ainda ao Ministério da Aeronáutica.
É indispensável ressaltar aqui que já desde as primeiras pesquisas espaciais, ainda no início da década de 60, e mesmo depois da nova organização dada em 1971 com a criação do INPE e da Cobae, as atividades conduzidas diretamente pelo Ministério da Aeronáutica tiveram notáveis avanços, marcados pelo desenvolvimento de vários tipos de foguetes brasileiros e inúmeros lançamentos feitos com sucesso inconteste, como atrás comprovamos.
Enquanto isso, por razões que desconhecemos, o mesmo ritmo de progresso não se observou nas atividades espaciais do braço civil, mesmo sob a direção da Cobae. Somente em 1979, oito anos depois de instituída esta Comissão, é que foram aprovados os estudos que deveriam ter sido feitos visando o planejamento e implementação do Programa da MECB, que, afinal submetida à presidência da República no início de 1980, foi aprovada oficialmente pelo governo brasileiro. Ou seja, enquanto o braço civil parecia estagnado em suas atividades espaciais, a Aeronáutica brasileira já há várias décadas vinha investindo recursos orçamentários e inteligência na pesquisa e criação de seus foguetes, desenvolvidos e lançados com inúmeros e repetidos êxitos dentro de um programa no qual, desde as suas origens, já estavam previstas a criação e a operação de um Veículo de Lançamento de Satélites integralmente brasileiro como etapa essencial da MECB. E é necessário ressaltar que essa decisão estratégica, mantida pelos sucessivos governos de então, teve caráter pioneiro, pois o Brasil foi um dos primeiros países do mundo a dar especial prioridade às atividades espaciais.
A MECB é, portanto, oficialmente uma decisão do governo brasileiro no sentido de ser implementado "um programa integrado, visando o projeto, o desenvolvimento, a construção e a operação de satélites de fabricação nacional, a serem colocados em órbitas baixas por um foguete projetado e construído no país e lançado de uma base situada em território brasileiro."
Por isso, depois da aprovação da MECB pela presidência da República, em 1980, passou a caber obrigatoriamente ao IAE (Instituto de Aeronáutica e Espaço) o desenvolvimento do VLS; ao INPE o desenvolvimento dos satélites e as estações de solo correspondentes; ao Centro de Lançamento de Alcântara (CLA) o encargo de realizar as atividades referentes à operação de lançamento do VLS; ao Centro de Lançamento da Barreira do Inferno operar como estação no acompanhamento dos lançamentos, com seus radares e meios de telemetria.
Não obstante estar bem clara a decisão do governo brasileiro ao institucionalizar a MCEB como parte essencial da Política Espacial Brasileira, a despeito disso desenvolveu-se, em relação a essa decisão oficial um oculto, mas grave e inconciliável, conflito de posições entre o Ministério da Ciência e Tecnologia e a AEB, ambos contestando radical, mas veladamente, a partir da sua concepção, a Política Espacial aprovada. Do outro lado, o então Ministério da Aeronáutica, este engajado com grandes e repetidos êxitos em realizar a sua parte da missão. Ocorre, porém, que essa "discordância" estratégica não é apenas teórica, porque tem vários ângulos e se desdobra até hoje em conflitos concretos, todos muito graves.
A questão nodal desses conflitos parece estar centrada na decisão de transformar ou não o Centro de Lançamento de Alcântara em um "espaçoporto internacional", ou manter o seu uso restrito, exclusivamente para lançamentos de veículos espaciais brasileiros portando cargas úteis nossas e de terceiros.
A primeira dessas alternativas, cujo viés é inequivocamente neoliberal, posto que suas consequências são implicitamente antinacionalistas, vem sendo esposada por titulares da direção da AEB, a começar pelo sr. Gylvan Meira Filho, seu primeiro presidente, que foi guindado a essa função — chave importantíssima para a implementação da MECB — tendo trabalhado para a NASA, segundo a revista Space New, e depois presidindo a AEB por longo período, durante o qual os dois VLS lançados explodiram, um em 1997 e o outro em 1999, e que ao deixar o cargo foi condecorado pela NASA pelos bons serviços prestados para aquela agência estrangeira, segundo a Folha on line.