Bolsa 15/24346-9 - Cana-de-açúcar, Duplicação gênica - BV FAPESP
Variação alélica em cana-de-açúcar: quantificação do polimorfismo de sequência
Análise da variação alélica em genes de importância econômica entre regiões hom(e)ologas do genoma de cana-de-açúcar (Saccharum Spp.)
Processo: 15/24346-9
Assunto(s): Cana-de-açúcar Duplicação gênica Polimorfismo de um único nucleotídeo
A cultura da cana-de-açúcar possui grande importância econômica devido à produção de açúcar e etanol, sendo o Brasil o maior produtor mundial de cana. Os cultivares modernos de cana-de-açúcar são híbridos interespecíficos (Saccharum officinarum x S. spontaneum), sendo seu genoma poliploide e aneuploide, fato que dificulta a construção de mapas genéticos e identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci). O conhecimento da variação na sequência de bases de diferentes alelos possibilita a obtenção de informações da variação inter e intra-genótipos de uma espécie. Uma técnica eficiente para se acessar a variação alélica entre locos hom(e)ólogos em uma espécie é através do sequenciamento de locos gênicos específicos e de interesse, identificados em clones BAC (Bacterial Artificial Chromosomes). Desta maneira, o presente projeto visa a descoberta e análise de polimorfismos alélicos existentes em regiões cromossômicas hom(e)ólogas de cana-de-açúcar e comparar a organização alélica entre estas regiões através da utilização de genes que codificam uma proteína DnaJ e uma Trealose-6-fosfato sintase/fosfatase. SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) encontrados serão utilizados para avaliar a expressão gênica de haplótipos específicos e poderão ser integrados a mapas genéticos em desenvolvimento. A análise destas regiões aliada a técnica de FISH (Fluorescent in Situ Hybridization) possibilitará a localização física dos genes estudados. No caso específico de cana-de-açúcar, a identificação da expressão alelo específica pode ajudar a explicar os mecanismos de expressão de cada dose de cada alelo.
CRUZ, MARIANA VARGAS; MORI, GUSTAVO MARUYAMA; SIGNORI-MULLER, CAROLINE; DA SILVA, CARLA CRISTINA; OH, DONG-HA; DASSANAYAKE, MAHESHI; ZUCCHI, MARIA IMACULADA; OLIVEIRA, RAFAEL SILVA; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Local adaptation of a dominant coastal tree to freshwater availability and solar radiation suggested by genomic and ecophysiological approaches. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, DEC 27 2019. Citações Web of Science: 1.