Depois que Hominid derrota o General, ele ejeta o navio e pára de pára-quedas no chão com segurança, mas uma águia o pega enquanto voa no ar e o deixa cair em uma esteira quando é morto por uma serra.
Os soldados da área 51 são os terceiros inimigos principais no mundo 3. Eles são os inimigos mais difíceis que você encontra no jogo, porque podem bloquear fatias de facas, socar o Hominid e jogá-lo quando o agarrarem.
Alien Hominid Clone é o chefe final que você luta no jogo. O clone é uma versão maior do Alien Hominid, criada pela Área 51, na esperança de defender qualquer ataque alienígena. O clone tem o mesmo ataque que o Hominid, incluindo granadas que atearam fogo ao chão inteiro.
A luta começa dentro da área 51 da base após a ajuda que você obtém do globo ocular e as brigas terminam no céu quando Hominid derrota a versão clone em uma versão gigante e lentamente caindo aos pedaços da nave espacial de Hominid.