Poucas situações angustiam mais os pais quanto o primeiro episódio de infecção urinária em seus filhos. Ela é abordada de modo distinto dos adultos, pois as causas e os fatores variam de acordo com a idade da criança.
De modo geral, em crianças abaixo de dois anos, os casos estão associados a malformações do trato urinário (alterações dos rins, ureter e/ou bexiga), que podem facilitar o crescimento de bactérias, favorecer a infecção urinária e resultar ou não em lesões nos rins, chamadas de cicatrizes. Nessa idade, tendem a ser mais grave e pode ocasionar internação.
Algumas destas malformações, como a hidronefrose (dilatação dos rins) já podem ser identificadas desde a gravidez, por meio de uma ultrassonografia.
Em crianças mais velhas, outros fatores começam a ficar mais frequentes: desde cálculos urinários até mesmo o esvaziamento inadequado da bexiga, representado por perdas, retenção ou alteração do intervalo entre as micções.