A primeira é que cada viagem no tempo tem uma período para acabar, Simmons diz que não tem controle sobre isso e quando o relógio chega a zero, quem não estiver na nave vai ficar para trás. Como Enoch no episódio.
A segunda é uma teoria minha. Devido às ações de Mack e Deke, Freedy acaba indo para o lado da HIDRA, além disso, os gêmeos Koening entram para S.H.I.E.L.D. por causa do encontro com eles em 1931.
O que me fez pensar em paradoxos, talvez a viagem no tempo na série esteja em loop, ou seja, os eventos no futuro foram solidificados pela presença deles ali. Como são pequenas coisas, ninguém saberia das ações até chegar o momento, se esse for o caso, os Chronicom vão precisar de outro plano para derrotar SHIELD.