Todos esses fatos, faziam de Alexandria do início do Século V, uma verdadeira panela de pressão. E no ano de 415, essa panela começou a estourar.
O historiador Sócrates conta que, na tarde de 8 de março de 415, quando voltava do Museu de Alexandria, Hipátia foi atacada em plena rua, arrancada de sua carruagem por uma multidão de cristãos enfurecidos. Ela foi arrastada pelas ruas da cidade até uma igreja, onde foi violentada, teve suas roupas rasgadas e sua carne arrancada dos ossos por conchas afiadas. Depois de morta, seu corpo despedaçado foi queimado fora dos limites da cidade e todos os seus trabalhos, destruídos.
Isto aconteceu pouco tempo depois de Orestes ter ordenado a execução de um monge cristão, que havia atacado o Governador a pedradas. A execução deste monge enfureceu o Bispo Cirilo e seus correligionários. Não se sabe ao certo sobre um possível envolvimento de Cirilo na morte de Hipátia. Mas depois desse episódio, Orestes desistiu de sua disputa com Cirilo e abandonou Alexandria.
Os assassinos de Hipátia jamais responderam por esse crime. A Biblioteca de Alexandria foi destruída e junto com ela, grande parte o conhecimento acumulado pela humanidade por séculos. Cirilo seguiu ampliando seu poder e sua influência no mundo cristão. Sempre foi exaltado pela Igreja. Depois de sua morte, 30 anos depois, Cirilo foi santificado. Hoje é conhecido por todos como “São Cirilo” e talvez você tenha um “santinho” dele aí na sua casa.