1.	A Comissão Coordenadora do Programa (CCP) é composta pelo coordenador, seu suplente e mais dois membros, todos orientadores do Programa, um representante discente do Programa, e seus respectivos suplentes, sendo todos eleitos por seus pares.
1.	O prazo para depósito da dissertação é de 48 (quarenta e oito) meses.
1.	O candidato ao título de Mestre Profissional deverá completar, pelo menos, 140 (cento e quarenta) unidades de crédito, assim distribuídas:
1.1.	No mínimo 20 (vinte) unidades de crédito em disciplinas. O estudante deverá cumprir no mínimo 12 (doze) créditos em disciplinas do programa e no mínimo 8 (oito) créditos em disciplinas eletivas.
1.2.	Cento e vinte (120) unidades de crédito no preparo da dissertação.
2.	A disciplina Metodologia Científica é obrigatória e deve ser cumprida no semestre da primeira matrícula do pós-graduando no programa.
3.	A lista das disciplinas do programa será divulgada semestralmente na página eletrônica do programa e na secretaria de pós-graduação do IQ-USP.
1.	A solicitação de credenciamento de uma disciplina deve vir acompanhada de justificativa que denote a importância do tema e coerência com as linhas de pesquisa do Programa de Mestrado Profissional contendo, também, objetivos, ementa, bibliografia, carga horária das atividades programadas e o número máximo e mínimo de alunos aceitos.
2.	No recredenciamento de uma disciplina, efetuado a cada cinco (05) anos, além dos aspectos contidos no item 1, devem ser consideradas a regularidade de oferta e a demanda por parte dos alunos.
3.	As solicitações de credenciamento e recredenciamento devem vir acompanhadas também dos nomes de até três professores doutores responsáveis pela disciplina e eventuais colaboradores, com curriculum vitae caso não pertençam ao quadro de orientadores do Programa.
4.	Os itens 1, 2 e 3 serão avaliados por relator designado pela CCP para esta finalidade.
1.	A CCP pode solicitar, até a data de início efetivo da disciplina, o cancelamento de uma turma, caso o ministrante se manifeste, por escrito, justificando com base no fato do número de alunos matriculados ser inferior ao número mínimo estabelecido para aquela disciplina ou por haver motivo de força maior.
1.	O Exame de Qualificação tem por finalidade avaliar a proficiência do estudante em conhecimentos em sua área de investigação, assim como em áreas correlatas relevantes para suas atividades, sua capacidade em compreender e analisar criticamente trabalhos científicos em sua área de pesquisa e seu potencial no sentido de dar um encaminhamento experimental adequado para solucionar o problema que lhe seja proposto.
2.	A inscrição no Exame de Qualificação deve ocorrer até 18 (dezoito) meses após a primeira matrícula, sendo exigido o cumprimento de, no mínimo, 12 (doze) créditos em disciplinas e proficiência em língua inglesa.
3.	O Exame de qualificação compreende a apresentação obrigatória de seminário para avaliação do desenvolvimento do projeto de pesquisa do pós-graduando. Este seminário poderá ser restrito ao público se houver resultados de interesse comercial ou envolver patentes em desenvolvimento.
5.	O Exame de Qualificação deve ser efetuado até 120 dias após a inscrição na secretaria de pós-graduação.
6.	O aluno que for reprovado no Exame de Qualificação poderá repeti-lo apenas uma vez, em prazo não superior a 120 (cento e vinte) dias a partir da data da realização do primeiro exame. A reprovação no segundo exame de qualificação resulta em desligamento do programa.
1.	Para depósito da Dissertação de Mestrado Profissional devem ser apresentados os seguintes documentos:
2.	No caso de divulgação no Banco Digital de Dissertações e Teses da USP, a dissertação poderá omitir partes que envolvam resultados de interesse comercial ou patente em desenvolvimento.
1.	O candidato aprovado na defesa da Dissertação de Mestrado, após homologação, fará jus ao título de Mestre Profissional em Tecnologia em Química e Bioquímica, acrescido da Área de Concentração Química ou Bioquímica.
1.	O aluno poderá solicitar à CCP que, para fins de computação de no máximo 4 (quatro) créditos especiais, sejam consideradas outras atividades realizadas após o ingresso no programa, às quais atribuirão os seguintes valores em créditos:
2.	O aluno não poderá ter créditos atribuídos pela participação no Programa de Aperfeiçoamento do Ensino (PAE).
3.	A empresa pagará, para cada pós-graduando ligado ao Programa de Mestrado Profissional e desenvolvendo projeto de pesquisa com temática de seu interesse, uma taxa de bancada para cobrir despesas pelo uso da infra-estrutura do IQ-USP.
4.	Para matrícula de pós-graduando funcionário(a) de empresas públicas ou privadas, será exigida carta de um chefe imediato, certificando-se do convênio estabelecido entre Universidade-Empresa e se comprometendo a liberar o funcionário(a) para as atividades exigidas durante o curso de Mestrado Profissional.