O programa tem como base um sistema totalmente informatizado, que automatiza a classificação dos candidatos inscritos usando como critério suas notas do Enem. Nesse processo, o estudante não precisa se submeter a provas presenciais e tudo é feito de forma online. As seleções para as vagas nas instituições de ensino são feitas duas vezes no ano, a primeira em janeiro e a segunda em junho.
Cada universidade define os próprios critérios para seleção de novos alunos e pode estabelecer pesos diferentes às notas do Enem de acordo com a área do curso pretendido. Por exemplo, se o candidato se inscreve para o curso de Medicina, as matérias relacionadas às de exatas e biológicas terão peso maior em relação àquelas que pertencem à área de humanas.