Anfilóquio nasceu talvez na Licaônia, hoje Kónya, na Turquia, entre 339 ou 340. Era filho de uma família que possuia alguma distinção na Capadócia. Seu pai, Anfilóquio, era um eminente advogado e sua mãe, Lívia, era mulher de admirável fineza e sabedoria.
Provavelmente, Anfilóquio era primo de primeiro grau de São Gregório de Nazianzo e se tornou amigo de São Basílio de Cesarea. Foi criado na mesma atmosfera incomum da aristocracia cristã de sua província natal. Estudou Direito, foi professor de retórica em Constantinopla. Enfrentando dificuldades financeiras, abandonou a capital imperial e mudou-se para perto de Nazianzo, para levar uma existência pacífica, poder cuidar de seu pai, já idoso, e levar uma vida religiosa mais próxima a Gregório de Nazianzo e Basílio de Cesarea.