O acervo do Museu D. João VI abriga, em especial, produções artísticas do século XIX e XX no Brasil. Após a inauguração estes documentos estarão disponíveis para ensino e pesquisa.
Segundo a diretora da EBA, professora Ângela Ancora da Luz, este acervo é fundamental para a memória da universidade.
O Museu fica no sétimo andar do prédio da reitoria na Cidade Universitária. A visitação deve ser pré-agendada e acontece de segunda a sexta, das 9 às 16 horas.