Todos os isótopos de tecnécio devem ser manuseados com cuidado. O isótopo mais comum, tecnécio-99, é um fraco emissor beta; tal radiação é interrompida pelas paredes de vidro de laboratório. O perigo principal quando se trabalha com tecnécio é a inalação do pó; tal contaminação radioativa nos pulmões pode representar um risco significativo de câncer. Para a maioria dos trabalhos, manipulação cuidadosa em um exaustor é suficiente; um caixa de luva não é necessário.