Embora seja amigavelmente chamada de tag, trata-se de verdade de um código javascript adicionado ao site.
Código esse que, se a implementação não for acertada, pode trazer problemas “simples,” como a falha de ativação da respectiva ferramenta.
Também, muitas tags empilhadas podem causar problemas de carregamento no site, deixando lento e prejudicando a experiência dos visitantes.
Ambos fatores relevantes para o posicionamento no Google e conversão no site: velocidade de carregamento e experiência geral no site.
De certa forma, esses ainda são “bons” problemas, pois significa que você consegue acessar o código do site e fazer alterações.
O cenário pode ficar pior quando não se tem o acesso direto ao código para fazer alterações de forma correta.