Metropolis está em polvorosa com a inauguração do Zigurate, uma superinstalação teoricamente destinada ao progresso da nação mas que, de acordo com alguns boatos e rumores, poderia ser um dispositivo criado com intenções bélicas. Shunsaku Ban, um investigador japonês, chega na surdina à Metropolis, juntamente com seu sobrinho Kenichi, para buscar informações sobre um tal de Dr. Laughton, cientista brilhante e criminoso envolvido no tráfico internacional de órgãos. O surgimento de Tima, uma avançada robô criada por Laughton, pode levar Shunsaku e Kenichi a conhecer um pouco mais sobre a sombria verdade que se esconde por trás de toda a tecnologia de Metropolis. Qual seria a verdadeira função do Zigurate, e qual seria sua ligação com Tima, Duque Red e o futuro de Metropolis?