No entanto, ainda são necessários estudos básicos como a identificação, classificação e nomenclatura de organismos no Brasil. A Taxonomia, também conhecida como Sistemática, segundo Senna & Magrin (1999) é de fundamental importância para o correto conhecimento da fauna e flora associadas a determinado ecossistema aquático, portanto, ferramenta indispensável para qualquer pesquisador, permitindo levantar um conjunto organizado de informações referentes a um dado organismo ou conjunto de organismos. Como apontado por Irgang & Gastal Jr. (1996), antes de efetuar discussões aprofundadas sobre os vegetais, estendendo essa idéia a todos os organismos, deve-se determinar corretamente quais espécies são, pois sem essa informação a análise de dados posterior poderá ter reduzido valor.
Vale ressaltar que a maioria dos aspectos teóricos e modelos utilizados na ecologia foi desenvolvido na região temperada sendo necessário adaptações à realidade tropical. Outros simplesmente não são aplicados à região tropical. Dessa forma, há sim necessidade do desenvolvimento de uma “teoria própria” aos ecossistemas aquáticos continentais tropicais, como apontado por Parentoni Martins & Araújo-Lima (2001).
Na atualidade, programas institucionais como o PROBIO, PRONEX, PROFIX, Pro-Doc, Instituto do Milênio, Fundos Setoriais e iniciativas de FAPs como da FAPESP, através de fundos de pesquisa como Projeto Integrado, Jovem Pesquisador, BIOTA e bolsas de formação de pós-doutorado mantém em atividade por vários anos numerosos e qualificados pesquisadores com considerável soma de recursos financeiros. O Programa Integrado de Ecologia – PIE, uma iniciativa do CNPq, visa otimizar recursos humanos e materiais para o desenvolvimento de ações concretas para a solução dos principais problemas ambientais no Brasil (Barbosa, 2001). O subprograma denominado Programa Brasileiro de Pesquisas Ecológicas de Longa Duração – PELD, constitui-se um esforço colaborativo entre cientistas e estudantes trabalhando nas diferentes regiões biogeográficas do país, compartilhando a responsabilidade de conduzir e apoiar pesquisas ecológicas nas áreas de produtividade primária / secundária, dinâmica de nutrientes, conservação da diversidade biológica, dinâmica de populações, organização de comunidades e ecossistemas, padrões e freqüência de perturbações naturais e impactos antrópicos. O Ministério do Meio Ambiente também implementou o Programa Nacional de Monitoramento Ambiental Integrado – MONITORE. Esse programa tem como objetivos: levantar informações e dados confiáveis sobre a qualidade ambiental no país e disponibilizá-los; coordenar, promover e difundir práticas e procedimentos de monitoramento ambiental; capacitar instituições para realizar trabalhos de monitoramento ambiental; desenvolver padrões metodológicos de coleta e análise de dados sobre a qualidade ambiental; desenvolver padrões estatísticos e amostrais para pesquisas significativas, em nível regional e nacional; promover o intercâmbio de informações; permitir uma análise integrada da situação ambiental no Brasil (Rizzo, 2001).
Essas iniciativas permitem estudos ambientais de envergadura possibilitando verificar padrões e testar/questionar hipóteses e teorias viabilizando a construção de modelos ajustados aos ecossistemas aquáticos tropicais, em particular ao Brasil.
Atualmente, os estudos ambientais no Brasil têm atingido níveis de complexidade que permitem a aplicação de recorte regional com a utilização de Sistemas Geográficos de Informação (SIG) (Xavier da Silva et al., 2001; Vicens et al., 2001). Outra abordagem regional é a valoração de unidades de conservação (Obara et al., 1999; Santos et al., 2001), e estudos de percepção ambiental (Del Rio & Oliveira, 1996). Também contamos com grande variedade de material bibliográfico versando sobre diversos aspectos da ecologia, em particular nos periódicos Revista Brasileira de Biologia, Acta Limnologica Brasiliensia e Anais da Academia Brasileira de Ciências. A partir de 1997, através de iniciativa da Sociedade de Ecologia no Brasil, também vem sendo publicados artigos na Revista Brasileira de Ecologia. Também existem importantes iniciativas de livros de ecologia incorporando a experiência de pesquisadores brasileiros escritos por Salgado-Labouriau (1994), Laroca (1995) e Pinto-Coelho (2000), além dos já tradicionais Schäfer (1985) e Esteves (1988).
A Limnologia teve seu início no século XVIII com medidas de temperatura em lagos e, conseqüentemente, o reconhecimento da temperatura e densidade da água como uma das mais importantes variáveis ambientais, fundamentais na explicação do padrão de circulação das massas de água (Esteves, 1988). Relativo aos métodos empregados nos estudos limnológicos, o método Winkler utilizado na determinação do teor de oxigênio dissolvido na massa de água, na atualidade modificado pela adição de azida (Golterman et al., 1978), já estava disponível para uso pelos limnólogos no final do século XIX. Apesar dos inúmeros e importantes estudos iniciais efetuados no século XIX, a Limnologia (a ciência das águas interiores - Lampert & Sommer, 1997), consolidou-se com um ferramental teórico e metodológico bem estruturado no período de 1900 a 1950 (Esteves, 1988). A partir desse período a Limnologia, como subdisciplina da Ecologia (Lampert & Sommer, op cit.), tomou corpo, desenvolvendo pesquisas relativas a importantes processos como produção primária e decomposição, substituição de espécies e de teorias, hipóteses e modelos, tais como do nicho ecológico, distúrbio intermediário, “microbial looping” e “trophic cascade”.
O desenvolvimento da Limnologia no Brasil pode ser dividido em quatro períodos (Esteves, 1988). O período compreendido do descobrimento até 1900 foi dominado por naturalistas estrangeiros e os trabalhos constituídos em grande parte por listagens de espécies. De 1900 a 1950 iniciaram-se as pesquisas no Brasil, principalmente pela permanência por longo período de pesquisadores de diversos países, entre eles destacando-se Stillman Wright e Hermann Kleerekoper. Este último tem adicional importância por ter sido um dos primeiros a escrever um livro sobre Limnologia (Kleerekoper, 1944). De acordo com Esteves (op cit.), no período compreendido entre 1950 a 1970 as pesquisas passaram a ter um caráter holístico, destacando-se os trabalhos conduzidos por Samuel Murgel Branco. Esteves (op cit.) considera o período a partir de 1970 mais profícuo, com a formação de diversos núcleos de pesquisas limnológicas distribuídos pelo país. Nesse período também foi constituída a Sociedade Brasileira de Limnologia (SBL), hoje uma entidade sólida, que a cada dois anos organiza importante evento científico nacional, o Congresso Brasileiro de Limnologia, e edita o periódico científico Acta Limnologica Brasiliensia, veículo de ampla divulgação nacional e um dos mais importantes periódicos na área de ecologia no Brasil. A SBL foi fundamental para a inserção da Ecologia / Limnologia no território nacional (Esteves et al., 1995). Pode-se também afirmar que a limnologia brasileira, em grande parcela, tomou corpo a partir da década de 70 através de estudos em reservatórios, particularmente em São Paulo (Henry, 1999a), destacado-se os trabalhos desenvolvidos por Arcifa (1972), Rocha (1975), Tundisi et al. (1977), Henry et al. (1978) e Shimizu (1978; 1981).
i) e j) Lagoas temporárias, região do Morro dos Conventos, Araranguá, SC. k) drenagem de rejeito de mineração, Criciúma, SC.
De significativa importância para o desenvolvimento da limnologia brasileira, como apontado por Esteves (1988), foram às pesquisas coordenadas pelo Prof. Dr. José Galizia Tundisi nos Programas de Pós-graduação em Ecologia e Recursos Naturais (UFSCar) e Ciências da Engenharia Ambiental (CRHEA/USP).
Também é um marco na limnologia brasileira a publicação do livro Fundamentos de Limnologia, escrito pelo Prof. Dr. Francisco de Assis Esteves. Além de ser uma obra de referência em português, discute importantes aspectos da limnologia utilizando em profusão exemplos retirados de pesquisas desenvolvidas em região tropical, particularmente nos ecossistemas aquáticos nacionais. Além dessa publicação, há um número cada vez maior de livros discutindo aspectos relativos aos ecossistemas aquáticos nacionais (Tundisi, 1988; Bressan, 1990; Costa, 1990; Carmouze, 1994; Sipaúba-Tavares, 1994; Müller, 1995; Tundisi et al., 1995; Trindade, 1996; Agostinho & Gomes, 1997; Tundisi & Saijo, 1997; Vazzoler et al., 1997; Esteves, 1998; Henry, 1999b; Pompêo, 1999; Rebouças et al., 1999; Tundisi & Straškraba, 1999; Von Sperling, 1999; Bozelli et al., 2000; Conte & Leopoldo, 2001; Sipaúba-Tavares & Rocha, 2001; Amaral & Bittrich, 2002).
Arcifa, M.S. Cladoceros planctônicos e aspectos de eutrofização da Represa de Americana no Estado de São Paulo. São Paulo: IB-USP, 1972. 65 p. (Dissertação)
Barbosa, F.A.R. Nova abordagem para ecologia e conservação no Brasil: Programa Integrado de Ecologia (PIE) e Pesquisas Ecológicas de Longa Duração (PELD). In: Garay, I.; Dias, B.F.S. (eds.) Conservação da biodiversidade em ecossistemas tropicais. Avanços conceituais e revisão de novas metodologias de avaliação e monitoramento. Petrópolis: Editora Vozes, 2001. p. 43-58.