Lugo tem uma longa trajetória política que se confunde, e muito, com sua vida religiosa. Ex-bispo católico, notabilizado pela imprensa por ter sido pai mais de uma vez enquanto ainda era membro efetivo da Igreja, Lugo é adepto da “Teologia da Libertação”, leitura religiosa dos princípios fundacionais do cristianismo que pressupõe uma missão libertadora e emancipadora das sociedades humanas a ser ultimada por uma Igreja encarnada na missão de realizar o “Reino de Deus” na Terra, e não apenas num “Paraíso Celestial”; envolvida portanto na transformação das sociedades, em defesa dos pobres da Terra e almejando a condição de justiça social que redimiria a própria humanidade. Isso fez com que Lugo se aproximasse de importantes movimentos sociais de esquerda, atuando mais incisivamente nos movimentos de luta pela terra, organizados por trabalhadores rurais.
É preciso dizer que, adepto da Teologia da Libertação e próximo do movimento de trabalhadores rurais sem terra, Lugo já poderia contabilizar dois poderosos inimigos: a aristocracia fundiária paraguaia, aliada ao capital internacional; e a própria Igreja que tem na figura de Joseph Alois Ratzinger, o Papa Bento XVI, seu maior perseguidor, basta lembrar ter sido ele que excomungou, quando ainda Cardeal, um dos fundadores do movimento, o brasileiro Leonardo Boff.
Ao ser eleito presidente, contando com a oposição portanto da Igreja e da elite fundiária paraguaia, Lugo interrompeu um período de 6 décadas de hegemonia do Partido Colorado, incluindo os 35 anos de uma das mais sanguinárias ditaduras militares latino-americanas, liderada por Alfredo Stroessner. Apesar do significativo apoio popular, que lhe permitira ganhar a presidência, Lugo ganhava ainda mais poderosos e numerosos inimigos políticos, anulando nas casas do Legislativo paraguaio qualquer condição de governabilidade.