A taxa Fernando de Noronha também poderá ser paga on-line no site oficial do governo, onde o visitante terá que realizar o seu cadastro e preencher um formulário de pagamento com alguns dados da viagem.
Lembre-se de pagar o boleto pelo menos três dias antes da data de vencimento, por causa do prazo para confirmação do pagamento. Os turistas que não o realizarem previamente poderão fazê-lo no aeroporto no momento do desembarque, onde haverá uma entrada exclusiva para quem pagou a TPA através da Internet.
Pilotos de aeronaves em serviço no arquipélago tem isenção da taxa pelo período de 72 horas e não precisam realizar o cadastro no site, apenas no aeroporto de Fernando de Noronha no momento do desembarque