O Jardim Botânico, como Região Administrativa, foi dividido pela Secretaria de Segurança Pública. Parte dele é atendido pela 5ª DP do Paranoá e a outra parte, pela 30ª DP de São Sebastião. O bairro não possui unidade própria da Polícia Civil. Este modelo de atendimento sobrecarrega as delegacias das regiões vizinhas – Paranoá e São Sebastião, bairros mais violentos, que registram delitos mais graves que as ocorrências advindas do Jardim Botânico, o que resulta na falta de investigação. Por isso, a comunidade do JB avalia de forma negativa esta subdivisão do bairro.
Esta divisão também está na raiz das falsas estatísticas, geradas por registros incorretos das ocorrências. A parte do JB atendido pelo Paranoá engrossa as estatística do Paranoá. O mesmo ocorre com São Sebastião. O Jardim Botânico, portanto, aparece como um bairro sem ocorrências, gerando a falsa ideia de um bairro seguro. Sobre esse fato, George Couto, do Departamento de Gestão da Informação, informou que o sistema foi aperfeiçoado e hoje as estatísticas estão 95% corretas, percentual dentro da confiabilidade do sistema.
A comunidade também levou à Polícia Civil casos de resistência no registro de ocorrências, quando as vítimas foram dissuadidas a não realizar o registro. Sobre isso, o Dr. Seba alertou que os cidadãos têm a opção de registrar ocorrências em qualquer delegacia. Caso haja negativas, o procedimento correto é informar à Ouvidoria da instituição. Foi solicitada ao Diretor Eric Seba a abertura da 30°DP para registro de flagrantes. Atualmente os flagrantes só podem ser registrados no Paranoá, ocasionando longos deslocamentos que imobilizam o efetivo da Polícia Militar. O processo dura longos períodos e desfalca o policiamento tanto no Jardim Botânico como em São Sebastião.