Existem determinadas condições clínicas em que o Mirena não deve ser utilizado. É necessário ponderar eventuais fatores que limitam a utilização deste dispositivo. A existência de outras opções de contraceção também pode interferir com a escolha do Mirena.
O dispositivo hormonal não é recomendado em mulheres com queixas de enxaquecas ou doença cardiovascular grave.