Na própria instituição temos realizados intercâmbios com os Programas de Pós-Graduação em Educação (campus de Goiabeiras) e em Ensino na Educação Básica (campus de São Mateus) da UFES. Externamente a UFES temos buscado um intercâmbio com Programa de Pós-Graduação em Educação em Ciências e Matemática do Ifes - Educimat/IFES/Campus vitória e o Polo 33/IFES/Campus de Cariacica, também pertencente ao Mestrado Profissional Nacional em Ensino de Física - MNPEF. Esses intercâmbios são estabelecidos através de atividades de cooperação por meio de projetos de pesquisa conjuntos, participação de bancas de julgamento de trabalhos, realização de palestras e apresentação de trabalhos em eventos promovidos pelos programas.
Ampliando a dimensão dos intercâmbios para o cenário nacional, em 2016 foram estabelecidas duas parcerias que culminaram no desenvolvimento de atividades no Seminário Interno do PPGEnFis, realizado em setembro de 2016. Com a UFRJ, contamos com a participação do Prof Carlos Eduardo Aguiar, no desenvolvimento do mini-curso "Mecânica Quântica Conceitual". Com a UFOP, tivemos a participação do prof Fábio Augusto Rodrigues e Silva, desenvolvendo o Seminário "Contribuição da Teoria da Atividade para as Pesquisas em Ensino de Ciências". Ambos professores também integraram bancas de qualificação dos mestrandos e participaram da Mesa Redonda sobre "Diferentes Abordagens no Ensino de Física".