O Município de São João do Manhuaçu integra o Território de Desenvolvimento Caparaó. Com área de 143km2, o território municipal compõe a Bacia do Rio Doce.
Em 2010, São João do Manhuaçu contava com população de 10.242 habitantes, dos quais 99,87% residiam em domicílios com energia elétrica, 97,77% contavam com coleta de lixo em seu domicílio, e 0,24% eram atendidos por serviços de abastecimento de água e de esgotamento sanitário inadequados. A renda per capita em São João do Manhuaçu era de R$484,15.
Nesse mesmo ano, a cada 1.000 crianças nascidas vivas em São João do Manhuaçu, 15,1 não deveriam sobreviver ao primeiro ano de vida. E, se os padrões de educação daquele ano se mantivessem ao longo de sua vida escolar, a geração de crianças que ingressava em 2010 na escola, quando completasse 18 anos, teria concluído 7,99 anos de estudo.
O Índice de Desenvolvimento Humano Municipal — indicador que considera dados de renda, educação e longevidade, tendo o valor 1,0 como melhor situação — de São João do Manhuaçu foi de 0,650 em 2010.
Segundo levantamento de 2017, o Município de São João do Manhuaçu compõe o Microterritório de Desenvolvimento de Manhuaçu, a Comarca de Manhuaçu, a Macrorregião de Saúde de Leste do Sul (Ponte Nova), a Microrregião de Saúde de Leste do Sul (Ponte Nova), e integra as áreas de abrangência da Superintendência Regional de Educação Manhuaçu e da Superintendência Regional de Meio Ambiente e Desenvolvimento Sustentável Zona da Mata.