Não demorou muito e começou também a transportar passageiros para os bairros da Zona Norte de São Paulo, trajeto normal até a Serra da Cantareira.
Em 1907 uma estação foi construída no Parque Dom Pedro II, que se tornaria a Estação Mercado, ponto mais central da cidade. Já em 1908 foi iniciada a construção do ramal Guapira (depois Ramal Guarulhos) que chegava até o Asilo dos Inválidos (o ainda hoje Hospital Geriátrico e de Convalescentes D. Pedro II) no bairro de Guapira, depois bairro do Jaçanã, que foi imortalizado na canção Trem das Onze de Adoniran. Com isto a estrada de ferro Cantareira se dividia em dois troncos com partida da Estação Areal (Veja o traçado abaixo) que ficava em frente da antiga Casa de Detenção de São Paulo (já demolida) onde hoje situa-se a Estação Carandiru da linha 1 do metrô de São Paulo.