GPUs e CPUs são coisas desconexas. Para a CPU funcionar você precisa de uma MB 100% compatível, mas é só. Para GPU você precisa de um slot PCIe única e tão somente. Se Nvidia ou AMD entrassem nesse tipo de briga de fazer suas GPUs e CPUs funcionarem mal com equipamentos uma da outra, o mercado perderia confiança e elas perderiam dinheiro. Não é assim que PCs funcionam. PC é algo modular desde a concepção e todas as tentativas de mudar isso fracassaram (nem a Apple conseguiu isso por sinal, não importa o quanto tenha tentado).
Ano passado a AMD lançou sua série 6000 de GPUs RX. Criaram um recurso de acesso direto à memória que supostamente só funcionaria com MBs da AMD. Adivinha o que os usuários descobriram pouco depois? Que a tal tecnologia funciona com Nvidia também. FreeSync era só para AMD, agora todas as GPUs Nvidia fazem uso sem problemas.