A revista Mare Nostrum, além de hospedada em um servidor institucional da Universidade de São Paulo, tem sua preservação digital assegurada pela Rede Cariniana, coordenada pelo Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Mais detalhes sobre o método estão no Guia de Preservação Digital de Periódicos.
Os conteúdos publicados pela revista Mare Nostrum estão disponíveis e são rastreáveis por vários outros bancos de dados por meio do protocolo OAI-PMH (Open Archives Initiatives - Protocol for Metadata Harvesting).