São Martinho procurou retomar contacto com numerosos prelados do Oriente, fazendo saber claramente que era preciso acabar com o monotelismo. Esta ousada atividade do Pontífice entretanto lá encontrou oposição. Por isso, em junho de 653 o exarca de Ravena, Calíope, criatura do Imperador Constante II, mandou prender o Papa quando estava na basílica de Latrão, que foi levado para Óstia. E de lá, depois de muitos sofrimentos e maus tratos, para Constantinopla.
À sua chegada, o Pontífice foi deixado por várias horas exposto aos insultos da plebe, e depois posto na prisão de Prandearia, onde ficou em cruel confinamento por 95 dias, sofrendo fome, calor e sede.