Depois de ter todas as suas memórias de volta, Bourne (Matt Damon) luta com o seu passado, procurando um meio de não seguir o caminho da vingança deixado por ele há muito tempo, até que Nicky Parsons (Julia Stiles) - que estava sendo caçada pela cia após hackear a agencia - retorna com informações secretas do passado de Jason. Agora cabe a ele dar fim nessa caçada que começou quando perdeu sua identidade anos atrás.
O filme definiu um gênero no qual muitos tentaram imitar, nunca alcançando a excelência da trilogia original, nem mesmo quando os produtores recriaram a magia com a quarta etapa da franquia: O Legado Bourne (2012). Isso porque faltavam os elementos mais importantes para capturar o resultado certo - que era Paul Greengrass e Matt Damon - que fica óbvio vendo o novo filme.