A fluoretação da água gera custos com produtos químicos, operacionalização nas unidades de tratamento e com as 60 mil análises realizadas. Cerca de 52 mil análises são feitas diretamente nas estações de tratamento e mais de 8 mil na rede de distribuição de água. Todo processo tem um custo mensal de R$ 650 mil.
Segundo dados do Ministério da Saúde, a aplicação do fluor possibilita, no mínimo, uma redução de 65% das cáries, desde que mantida a continuidade e a regularidade dos teores do flúor na água.