No SEI há a possibilidade de configurar os sistemas externos que podem acessar os serviços disponibilizados.
Antes disso, é necessário cadastrar o sistema e realizar a associação com os respectivos serviços, sendo possível indicar o tipo de processo, de documento e as unidades permitidas.
Os serviços são descritos em formato XML, em um padrão denominado Web Services Description Language (Linguagem de Descrição de Serviços Web). Além de descrever os serviços, esse padrão especifica como acessá-los e quais operações ou métodos estão disponíveis.