Em 1991, a Escola de Enfermagem da UFMG sediou o Programa de Desenvolvimento da Enfermagem (PRODEN), definindo, entre suas linhas de trabalho, a criação da Rede de Escolas de Enfermagem de Minas Gerais, que passou a integrar a Rede de Enfermagem da América Latina (REAL). O PRODEN tinha como objetivos possibilitar e incentivar o intercâmbio e a divulgação do conhecimento em Enfermagem na América Latina. Foram criados o Curso de Mestrado em Enfermagem, em 1994, e a Revista Mineira de Enfermagem (REME), em 1996. Um dos desafios da Enfermagem Mineira, tendo a EEUFMG à frente das propostas, foi o de desenvolver a Estratégia de Saúde da Família, que representou mudança importante no modelo assistencial brasileiro. Houve alterações críticas nos currículos dos cursos de Enfermagem, de especialização e de capacitação dos profissionais de saúde para responder aos novos tempos da organização dos serviços e da assistência em saúde no País.
O Século XXI trouxe o desafio de mais um curso de graduação na EEUFMG. O curso de graduação em Nutrição foi criado em 2004, exigindo expansão também do espaço físico da Escola. Em 2006, foi inaugurado um novo bloco (Sul) e revitalizada a fachada do antigo prédio, agora denominado Bloco Norte da Escola de Enfermagem. O Curso de Mestrado foi reformulado, tornando-se multiprofissional em 2004 e, em 2005, a pós-graduação se ampliou com a criação do Curso de Doutorado em Enfermagem, constituindo o Programa de Pós-Graduação. Em 2009, mais um curso de graduação foi criado, no horário noturno, em Gestão de Serviços de Saúde.
O processo de estruturação da Escola como unidade acadêmica autônoma e de qualidade se consolida com o crescimento do ensino de graduação e pós-graduação, da pesquisa, e da extensão. Os novos cursos de graduação e pós-graduação têm crescimento constante. Surge a necessidade de novos espaços para abrigar laboratórios de pesquisa e de ensino. Assim, as comemorações dos 80 anos da EEUFMG são marcadas pela aprovação do projeto de construção de um novo prédio, em andamento.