As secretarias estaduais e distrital de educação têm um papel fundamental na execução do Mediotec, atuando como parceiros demandantes de público a ser atendido. São responsáveis pela seleção dos alunos a serem matriculados e pelo encaminhamento dos alunos para as instituições ofertantes de cursos.
As instituições privadas que atendem aos requisitos previstos nos editais devem apresentar suas propostas por intermédio do Sistema Nacional de Informações da Educação Profissional e Tecnológica (Sistec), no prazo previsto em edital. As instituições públicas devem participar do processo de pactuação.