Eu tive sorte com isso. Estudei em uma faculdade católica, mas com a maioria esmagadora dos professores de esquerda.
Mas convivíamos bem na aula e nos intervalos. Se passasse disso já encrencava. Os evangélicos lá percebem quem é ou não "da igreja".
As poucas encrencas que vi foram entre evangélicos e católicos. Uns não entendem pq outros têm santos, veneram Maria e etc.
O preconceito era mesmo entre eles. Conheci uma evangélica que se divorciou duas vezes, está no terceiro casamento, o marido tem o sobrenome dela e os dois não querem filhos. Nem todo evangélico concorda com isso. A maioria é de direita, mas havia religiosos de esquerda, que diziam que a bíblia tem partes socialistas.
Como é um curso de música, há os que pensam que rock é coisa do diabo, mulheres que não tocam em bandas à noite pq o namorado não deixa, homens e mulheres que só tocam na banda da igreja e somente música gospel.
Lamento muito o que vc passou, eu acredito que tive muita sorte no lugar onde estudei. E se eu tivesse algum problema com eles, provavelmente teria o apoio da coordenação do curso, pois não era composta por religiosos.