A exemplo dos portenhos, o sistema defensivo também é um ponto sólido do Santa Fé. Até o momento, a equipe disputou 10 jogos na Copa Sul-Americana e foi vazada seis vezes. Jogando fora de casa, esse retrospecto se mantém positivo. Foram cinco partidas longe de El Campín, com três gols sofridos. Na condição de visitante, o time não foi vazado em três oportunidades.