No século X os monges beneditinos instalaram-se na abadia e uma pequena vila foi formando aos seus pés. Durante a Guerra dos Cem Anos, entre a França e a Inglaterra, o Monte Saint-Michel foi uma fortaleza inexpugnável, resistindo a todas as tentativas inglesas de tomá-la e constituindo-se, assim, em símbolo da identidade nacional francesa. Após a dissolução da ordens religiosas ditadas pela Revolução Francesa de 1789 até 1863 o Monte foi utilizado como prisão.