metadata.teses.dc.title: Estratégias de predição de cruzamentos não realizados em análise dialélica, utilizando informações de marcadores moleculares
metadata.teses.dc.title.alternative: Alternatives for predicting effects of missing crosses in diallels, with information from molecular markers
metadata.teses.dc.creator: Silva Filho, João Luis da
metadata.teses.dc.contributor.advisor1: Bearzoti, Eduardo
metadata.teses.dc.date.submitted: 13-May-2004
metadata.teses.dc.identifier.citation: SILVA FILHO, J. L. da. Estratégias de predição de cruzamentos não realizados em analise dialética, utilizando informações de marcadores moleculares. 2004. 70 p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2004.
metadata.teses.dc.description.resumo: Os cruzamentos dialélicos estão entre as estratégias mais utilizadas pelos melhorista para a escolha de genitores e ou populações segregantes. Uma de suas principais limitações, contudo, é o trabalho demandado na realização de cruzamentos, que cresce geometricamente à medida que o número de genitores que se deseja intercruzar aumenta. O presente trabalho teve por objetivo apresentar diferentes estratégias de predição de cruzamentos não realizados em análise dialélica, utilizando dados de marcadores moleculares. Foram utilizados dados de experimentos com a cultura do feijoeiro, envolvendo 120 cruzamentos derivados de 22 genitores (de quatro diferentes raças), avaliados em três locais do estado de Minas Gerais. A disponibilidade de uma matriz de padrões moleculares dos genitores (matriz de "0´s" e "1´s"), constituída por 136 produtos polimórficos de marcadores RAPD, permitiu a aplicação de metodologias que utilizam diferentes princípios para a predição de cruzamentos não realizados, as quais são caracterizadas a seguir: (i) modelo aditivo, em que a predição dos cruzamentos não avaliados foi realizada com base nas capacidades gerais de combinação dos genitores, estimadas a partir dos cruzamentos avaliados em que eles participaram; (ii) modelo de distância, similar ao modelo aditivo, contento apenas a informação adicional de uma covariável, cujo valor atribuído a cada cruzamento foi a distância genética entre os genitores, calculada a partir dos maracadores moleculares; (iii) modelos de regressão fatorial, em número de quatro, que também fazem uso de covariáveis, só que calculadas a partir dos escores dos quatro primeiros componentes principais da matriz de "0" e "1", em que cada produto de amplificação foi tomado como uma variável; (iv) metodologia de modelos mistos, considerando duas situações: a primeira delas, desconsiderando a endogamia existente nos cruzamentos, dado que os genitores são aparentados e a segunda, considerando a endogamia dos cruzamentos, numa tentativa de minimizar sua influência sobre as predições dos cruzamentos não avaliados. Perdas de 12, 24, 36, 48 e 60 cruzamentos foram simuladas 1000 vezes cada uma para os modelos aditivo, de distância e de regressão fatorial, e 250 vezes para as equações de modelos mistos, sendo, então, seus valores preditos com base no desempenho dos cruzamentos avaliados. Em cada simulação, estimavam-se as correlações de Pearson e de Spearman entre os valores preditos dos cruzamentos e os valores fenotípicos observados. Ao longo das simulações obtidas para cada modelo em cada tamanho de perda, foram estimadas as correlações médias, mínimas, máximas e desvios padrões. Em todos os modelos, houve uma tendência de se obter maiores correlações quando se tinha um maior número de cruzamentos preditores (menor número de perdas simuladas). Os modelos de regressão fatorial apresentaram melhores estimativas de correlações entre os valores preditos e observados. As equações de modelos mistos e o modelo de distância apresentaram resultados similares. A inclusão da covariável nas equações de modelos mistos não trouxe nenhum benefício às predições, provavelmente devido ao fato das estimativas das endogamias dos cruzamentos, tomadas como covariáveis, terem sido muito próximas entre si.