O MEV JSM-5200 da JEOL possui resolução de 5nm e está adaptado para adquirir imagens digitais. Possui ainda um programa para análise de imagem e morfometria. A microscopia eletrônica de varredura permite o estudo detalhado das superfícies celulares. A microscopia eletrônica de varredura também é utilizada na análise de materiais aplicados à indústria e à biotecnologia.