Auxílio à pesquisa 18/00031-7 - Biologia computacional - BV FAPESP
Avanços na Teoria de Rearranjos de Genomas Baseada em Matrizes
Processo: 18/00031-7
Bolsa(s) vinculada(s): 20/00975-5 - Aplicações da Teoria Matricial de Rearranjos de Genomas, BP.TT
Este projeto busca avançar a teoria matricial de rearranjo de genomas,introduzida por Meidanis, Zanetti e Biller, aplicando-a a casos práticosde comparação de genomas de micróbios, fungos, plantas e mamíferos,através de colaborações com biocientistas. Os principais problemas aatacar aqui giram em torno da construção de filogenias usando rearranjos,e a inferência dos genomas ancestrais nos nós internos destas filogenias.Ao mesmo tempo, é objetivodo projeto refinar os métodos do ponto de vista matemático e computacional,aperfeiçoando os algoritmos que os implementam, e complementando-oscom ferramentas de suporte para facilitar seu uso na prática. (AU)