Mas o ideal seria em Painel de controle Módulos HTML & JavaScript Gestão dos códigos JavaScripts Criar um novo JavaScript e adicionar o código com Investimento em Todas as páginas.
Então ... quando a pessoa cai no formulário de apresentação, se ela clicar em inicio, a mensagem para de aparecer. Não tem como colocar esse código para aparecer para as pessoas que tem 0 mensagens, e ele ser bloqueado somente no formulário? tipo que colocar no formulário um código que bloqueia qualquer mensagem em alert()?
Impedir que o usuário navegue pelo seu fórum antes de se cadastrar tende a ser prejudicial, pois o mesmo não saberá como o fórum é para então decidir pelo cadastro: Por que se cadastrar em algo que desconheço? Mas se esse for o desejado, troque o script por esse: