Para piorar a situação, a recente linhagem identificada no Amazonas - e possivelmente culpada em boa parte pelo caos sendo testemunhado em Manaus nas últimas semanas - possui mudanças na proteína Spike similares àquelas presentes na linhagem 501Y.V2 (417T, 484K no domínio RBD, e 18F, 20N no domínio NTD). Segundo os pesquisadores, os dados do estudo sugerem que essa linhagem provavelmente exibe significativos níveis de resistência à neutralização, tornando-a também uma considerável preocupação de saúde pública. De fato, já existe um caso confirmado de infecção com a cepa Amazônica (!). A emergência independente de ambas as linhagens suporta a hipótese de origem das duas a partir de seleção contra anticorpos neutralizantes comumente compartilhados entre a população, assim que a imunidade populacional (nível de infectados) começou a aumentar em um cenário de descontrole epidêmico.
Por fim, essas variantes podem comprometer em alguma extensão a eficácia das vacinas sendo testadas - já que são baseadas em linhagens prévias -, o que reforça a necessidade de plataformas de vacinas que sejam prontamente adaptáveis, como as vacinas de mRNA (ex.: Pfizer e Moderna), e a necessidade de identificar alvos virais menos mutáveis para a incorporação em futuros imunogênicos. Se essas variantes acumularem mais mutações, pode ser que algumas vacinas já em uso percam grande parte da eficácia. Ao mesmo tempo, as pessoas precisam reforçar as medidas de prevenção não-farmacológicas, como uso de máscaras e distanciamento social, visando frear a disseminação dessas preocupantes linhagens e dificultar a emergência de mais mutações associadas a evasão imune.