Assim, foi realizado um acordo entre a força tarefa do MPF e a Petrobras — homologado pela 13ª Vara Federal Criminal em Curitiba. Estabeleceu-se que a Petrobras teria o compromisso de manter um conjunto de medidas com vistas a evitar novos crimes, aprimorando seus controles internos, bem como de depositar em juízo o valor de US$ 682.560.000,00 convertidos em reais. A importância corresponde a 80% do valor das multas estabelecidas nos acordos com as autoridades norte-americanas. Assim, a quantia de cerca de R$ 2,5 bilhões foi depositada em conta judicial perante a 13ª Vara Criminal de Curitiba.
Segundo o acordo, metade do valor seria destinado aos acionistas minoritários da Petrobras, que foram lesados com os escândalos de corrupção. Os outros 50% constituiriam um fundo patrimonial (endowment), administrado por fundação de interesse público a ser constituída.
Entretanto, enquanto estavam sendo estudadas as possibilidades de constituição de referida fundação, a então Procuradora-Geral da República (PGR), em março de 2019, ajuizou uma ação junto ao Supremo Tribunal Federal. A PGR entendeu que o dinheiro não poderia ser destinados pela Lava Jato e pediu a anulação da decisão judicial que homologou o acordo entre a Força Tarefa e a Petrobras.
O ministro Alexandre de Moraes, relator do caso, acolheu o requerimento da PGR, sob argumento de que os membros do MPF da Força Tarefa não teriam atribuição para fixar e destinar receitas públicas — uma competência do Congresso Nacional. Por fim, o ministro determinou a suspensão dos efeitos da decisão do Juízo da 13ª Vara Criminal Federal, com consequente bloqueio dos valores e encaminhamento destes a conta judicial vinculada ao STF, para que, futuramente, fossem destinados à educação.