Baixas concentrações de íons de flúor na pasta de dentes e água potável podem ajudar a prevenir cáries dentárias, enquanto concentrações mais altas de flúor são usadas em alguns inseticidas. Muitos anestésicos gerais importantes são derivados de hidrocarbonetos fluorados.
Também é uma fonte de pósitrons para imagens médicas pela técnica chamada PET (tomografia por emissão de pósitrons), além do hexafluoreto de urânio ser usado para separar o isótopos de urânio e produzir urânio enriquecido para usinas nucleares.