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O Curso de Mestrado Acadêmico em Filosofia da UECE foi fundado em 1998. Sua origem remete à experiência de ensino de pós-graduação lato sensu impulsionado pelo Núcleo de Estudos de Pós-graduação em Filosofia (NUFIL), durante toda a década de 1990, e, antes ainda, da larga experiência de ensino de graduação durante décadas (desde a antiga Fafice, Faculdade de Filosofia do Ceará). Reconhecido pelo Capes em 2004, nosso curso mantém a nota 3,0 (três), caracterizando-se por um programa em fase de consolidação.
Suas Linhas de Pesquisa (Ética Fundamental, Ética e Filosofia Social e Política, Ética e Estética) se constituíram com base na formação e na experiência de ensino de seu corpo docente, centradas na reflexão ética, política e social de pensadores antigos (gregos e romanos), medievais (cristãos e árabes), modernos e contemporâneos.
Atualmente com doze professores em seu corpo permanente, tem contribuído para a formação de professores para o ensino médio e superior de filosofia em nosso Estado e em Estados próximos.
Anualmente, o programa realiza o Seminário de Pesquisa do Mestrado Acadêmico em Filosofia (Sempesq), evento que reúne seus corpos docente e discente que tornam público, através de conferências, minicursos e comunicações, os resultados parciais e/ou finais de suas pesquisas. Além desse, outros eventos se realizam com periodicidade anual, realizados pelos diversos Grupos de Pesquisa: Colóquio Hegeliano, Colóquio de Teoria Crítica e Estética, Colóquio Benedictus de Spinoza, Colóquio Walter Benjamin e Seminário dos Afetos.
Desde sua fundação, o Mestrado em Filosofia da UECE conta com o apoio da Fundação Cearense da Amparo à Pesquisa (Funcap) e, a partir de seu reconhecimento em 2004, da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES), através de concessão de bolsas de estudo e, no caso da CAPES, também de recursos financeiros provenientes do Programa de Apoio à Pós-graduação (Proap).