O templo foi reformado no século XVIII, como o demonstra a sua frontaria. Esta é marcada no piso térreo por uma galilé de três arcos plenos sobre pilares retangulares. No interior está resguardado o portal manuelino da igreja, de cariz vegetalista. Sobre a galilé rasga-se uma elevada janela com frontão mistilíneo, ladeada por dois nichos barrocos vazios. A empena é formada por movimentada composição barroca mistilínea e encimada por cruz de dupla travessa. Lateralmente eleva-se a torre sineira, marcada por fogaréus e cúpula bolbosa.
A cobertura da nave da igreja foi reformada no século XVII, contendo este espaço alguma da melhor tumulária nacional dos séculos XV-XVI. Logo à entrada são visíveis os túmulos de dois alcaides de Montemor-o-Velho, Gonçalo Aires da Silva e o neto Aires Gomes da Silva, marido da fundadora e morto na Batalha de Alfarrobeira. Surge depois o mais emblemático túmulo do século XV, obra de Diogo Pires-o-Velho realizada em 1481. Trata-se do túmulo de Fernão Teles de Meneses e o seu tranquilo jacente está sob um baldaquino gótico, cujo cortinado é afastado por duas figuras selvagens. Na face frontal da arca tumular podem observar-se os brasões dos Silva e dos Meneses. Frontal a este magnífico túmulo quatrocentista está o não menos elegante púlpito do século XVI, obra do escultor Diogo Pires-o-Moço.
A capela-mor é um espaço igualmente soberbo, concebido por Diogo de Castilho e coberto por uma abóbada ogival polinervurada. O seu retábulo-mor em pedra calcário policromada é uma obra superlativa do escultor francês Nicolau Chanterene. Nele se narra o Descimento da Cruz, tendo lateralmente as figuras dos doadores com S. Jerónimo e S. Marcos. Na predela observam-se quatro episódios da vida de S. Jerónimo.
No lado direito do retábulo situa-se o túmulo renascentista do cavaleiro João da Silva (1559). Depois pode-se ver o túmulo da fundadora e de dois outros cavaleiros desta família, onde os jacentes manuelinos se combinam harmoniosamente com a arquitetura renascentista., ambos obra do escultor Diogo Pires-o-Moço.