As etapas seguintes são constituídas pela separação e classificação das sementes, tratamento e, por fim, ensaque.
Durante a classificação, a massa de sementes passa por diversas conformações de peneiras para que sejam agrupadas em caixas de acordo com tamanho, densidade e cor. Essa divisão garante ao produtor que os discos utilizados na plantadora funcionarão de maneira adequada, evitando falhas ou sementes duplas no plantio. A massa de sementes que estava armazenada nos silos passa por transportadores e elevadores até alcançar, no último andar, o silo pulmão, o qual possui capacidade de armazenar 10 toneladas. Através deste, as sementes seguem um fluxo decrescente pela torre, passando pelas peneiras e trieurs. Na planta de Santa Helena existem duas linhas de processamento dentro da torre a partir da classificação.
O próximo estágio é o tratamento, no qual as sementes são tratadas para diversas finalidades, variando de acordo com a região, híbrido, entre outros fatores. Normalmente são adicionados inseticidas e fungicidas.
As avaliações das perdas foram feitas nos transportadores e elevadores conforme Figura 10. O transportador 4-101 transporta as sementes secas armazenadas nos silos para o silo pulmão da torre, onde estas passarão pela pré-limpeza da torre e posterior classificação por tamanho. Os elevadores M4-329 e M4-330 têm a mesma função, embora em linhas diferentes, de transportar as sementes classificadas que estão nas caixas para a classificação por densidade e cor na Coluna de Ar e Color Sorter.