O CQMED (Centro de Química Medicinal de Inovação Aberta) é uma Unidade EMBRAPII especializada na área de biofármacos e fármacos. Formada por pesquisadores do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética e do Instituto de Biologia da Unicamp, em uma parceria com o Structural Genomics Consortium (SGC) (www.thesgc.org), o CQMED opera uma plataforma "do gene ao probe" para a identificação de novos alvos terapêuticos.
A Unidade integra o modelo de inovação aberta do SGC utilizando um modelo de parceria público-privada focada na descoberta de novos alvos terapêuticos. Tem como foco a integração de empresas farmacêuticas brasileiras no modelo SGC de consórcio pré-competitivo, impulsionando, assim, a descoberta de novas drogas no país.