Perante a sistemática negação da Igreja local em admitir nem sequer a mera possibilidade da sobrenaturalidade dos feitos; perante a rejeição das mensagens, quatro anos depois, a Mãe de Deus teve que dar, não Ela, mas o Arcanjo São Miguel, a mensagem seguinte:
"Muitos cardeais, muitos bispos e muitos padres estão no caminho da perdição e com eles estão conduzindo muitas almas."
Esta parte da mensagem foi a mais difícil de aceitar por alguns membros da Igreja que eram os que deviam dar o seu parecer sobre a autenticidade das mensagens. Dizia-se - Como era possível que Nossa Senhora, Mãe da Igreja, pudesse falar nestes termos? Não se queria ver o fundo da verdade daquilo que estava a acontecer. Os escândalos e os erros graves na doutrina iam-se estender e iam abarcando regiões inteiras.
Nas meditações famosas da Via Crucis de 2005, o então Cardeal Ratzinger advertiu-nos quanto à decomposição interna da Igreja. Na nona estação disse: "Quanta sujidade na Igreja e entre os que, pelo seu sacerdócio, devem estar entregue a ela! Quanta soberba, quanta auto-suficiência! (Está presente na sua paixão) a traição dos discípulos, a recepção indigna do Seu corpo e do Seu Sangue (comunhões sacrílegas e também mencionou as celebrações eucarísticas indignas), é certamente a maior dor do Redentor, a que lhe trespassa o coração. Não nos resta mais nada senão gritar desde as profundezas das nossas almas: Kyrie, eleison Senhor, salva-nos..."
Na oração que seguiu à meditação acrescentou:" Nós que te traímos, não só com os gestos pomposos e as palavras sonantes. Tem piedade da tua Igreja... Ao cair, caímos em terra e Satanás alegra-se porque pensa que já não nos poderemos levantar; espera que Tu, ao seres arrastado na queda da Tua Igreja, caias para sempre. Mas Tu te levantarás. Tu reincarnaste, ressuscitaste e podes levantar-nos. Salva e santifica a Tua Igreja. Salva-nos e santifica-nos a todos."
O Santo Padre está consciente de que os maiores perigos que deve enfrentar a Igreja não vêm de fora, mas de dentro e não só pelos escândalos de ascensão social, de dinheiro e do pecado contra o sexto mandamento, na sua forma mais perversa e mais execrável, mas sobretudo pelo maior dos perigos: a perda da fé. Em muitos seminários e centros de formação, a falsa teologia continua a fazer estragos provocando no melhor dos casos confusão quando não provoca um cepticismo nos jovens piedosos e crentes. Nos seminários, psicólogos e sociólogos tomaram os lugares dos directores espirituais. Nas universidades católicas, muitas são as cadeiras que servem para corroer a fé, insinuando incertezas. Principalmente com estudos da Bíblia que tratam a palavra de Deus não como sendo inspirada pelo Espírito Santo mas como um cadáver que se deve dissecar. Enquanto que se expõe meras conjecturas como se fossem verdades irrecorríveis por virem de um saber supostamente científico, os dogmas de fé são postos dissimuladamente ou até abertamente em dúvida. Por exemplo, nas universidades, algumas pontificas, questiona-se a verdade histórica de Ressurreição e põe-se em dúvida a própria divindade de Jesus Cristo. O chamado método histórico-crítico é para esta teologia a única medida para a verdade e para as evidências.
Eu, a Vossa Mãe, pela intercessão de S. Miguel, peço que vos emendeis. Estais a receber o último aviso. Amo-vos muito e não quero a vossa condenação."
O tempo que resta até que se manifestem grandes acontecimentos é muito breve. No rigor da verdade, estes acontecimentos já começaram. Basta só querer ver a apostasia geral, a rebelião das nações contra a lei de Deus, a perseguição aos cristãos que não é outra coisa que a guerra ao Cordeiro, a grande obscuridão que se tece sobre o mundo. Mas, o Senhor não nos deixa sós. Ele prometeu que estará connosco até ao fim do mundo e que as portas do Inferno não prevalecerão sobre a Sua Igreja. (Cfr Mt 28:20 e Mt 16:18).