O presidente criticou mesmo o seu ministro da Saúde dizendo que "ele quer aparecer, como o [Luiz Henrique] Mandetta", que foi o primeiro titular da Saúde do governo, demitido logo no início da pandemia por discordar do uso de cloroquina e da flexibilização do distanciamento pretendidos por Bolsonaro. Nelson Teich, o seu sucessor, também saiu por motivos semelhantes. Ambos são médicos. O general paraquedista Pazuello, terceiro ministro em plena pandemia, foi escolha pessoal do presidente.
Bolsonaro sugeriu, no entanto, que o ministro cometeu "traição" ao associar-se a Doria, que chamou de "vitória do Brasil" o acordo estabelecido com o Ministério da Saúde.
O pano de fundo da guerra em torno da vacina de origem chinesa e em parceria com o instituto paulista são as eleições de 2022 para as quais Bolsonaro e Doria, que eram aliados em 2018, são considerados pré-candidatos e rivais.
"Andou a recomendar cloroquina até às emas do Alvorada", disse, noutro ponto da guerra, Doria, referindo-se a uma fotografia em que Bolsonaro, quando estava em quarentena, mostra embalagens daquele remédio aos animais que habitam os jardins da residência oficial do presidente. Para o governador paulista essa é a prova de que Bolsonaro jamais se preocupou com medicamentos "comprovados cientificamente".
Entretanto, governadores de outros estados, que já contavam com a Coronavac, ficaram revoltados com a interrupção, por Bolsonaro, do acordo entre Doria e Pazuello. "Bolsonaro não pode dispor da vida das pessoas para seus propósitos pessoais (...) se ele desautorizar o acordo feito por Pazuello, ele mais uma vez estará sabotando o sistema de saúde (...) espero que bons conselheiros consigam debelar esse novo surto de Bolsonaro", disse Flávio Dino, governador do Maranhão e também tido como pré-candidato à presidência em 2022.