Como premiação, a ONHB oferece 15 medalhas de ouro, 25 de prata e 35 de bronze. Certificado do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) também são entregues a todos os participantes da competição, desde a primeira fase. Para os professores orientadores, a Unicamp oferece gratuitamente um curso de formação, com duração de uma semana.