O valor da taxa de inscrição é de R$ 68 e o pagamento poderá ser realizado até dia 25 de maio em qualquer agência bancária, Correios ou casas lotéricas. Todos estudantes que estão concluindo o ensino médio em escolas públicas estão automaticamente isentos do pagamento. Já os alunos de baixa renda que não estejam matriculados em unidade pública de ensino poderão declarar carência para conseguir isenção. Durante o período de inscrição, o sistema avisará se o pedido foi aceito.
O Ministério da Educação (MEC) espera que aproximadamente oito milhões de estudantes façam as provas deste ano. Na edição de 2015, 5,8 milhões de candidatos participaram do exame. A nota do Enem poderá ser usada na seleção para universidades públicas, bolsas do Prouni e seleção para o Fies.