A teoria mais difundida é que a "gosma negra" seja um tipo de substância que causa alterações genéticas aceleradas. Uma teoria recorrente é que os alien (os xeno-morfos) teriam surgido e evoluído a partir dessa gosma. Alguma falha grave teria feito os alien aparecer acarretando a destruição das instalações que era mantida no planeta. O final do filme deixa claro que o monstro nascido de Elizabeth Shaw (aquela lula pequena que se torna uma lula gigante) era uma espécie de Alien Facehuger primitivo, tanto que ele contamina o Engenheiro inserindo um tubo por via oral nele. O resultado é o nascimento de um xeno-morfo mais convencional.
A pergunta original sobre porque a gosma age de diferentes maneiras em cada pessoa, não é explicada de forma razoável e infelizmente parece que vai ficar para outro filme.
3 - Porque os personagens arqueólogos concluem que as imagens e inscrições encontradas são um convite?
O filme se inicia com dois arqueólogos descobrindo inscrições em uma caverna na Escócia. Logo ficamos sabendo que inscrições e símbolos semelhantes apareciam em várias culturas e civilizações diferentes ao longo da história. Aparentemente a configuração de cinco estrelas, comum em todas as descobertas realizadas, está associada a um sistema solar com um planeta capaz de sustentar vida, localizado a 35 anos luz de distância.
Elizabeth Shaw, a arqueóloga religiosa, conclui que aquelas inscrições significam que uma raça alienígena deixou uma espécie de convite para que a raça humana a encontrasse. Ela conclui também que aquela mesma raça alienígena é responsável por criar a humanidade.
Nenhuma evidência para essas duas hipóteses é apresentada, mas Elizabeth aparentemente "escolheu acreditar" nelas. E aparentemente o poder de convencimento dela é incrível, pois ela consegue convencer o idoso dono de uma mega-corporação espacial a bancar uma expedição de "um trilhão de dólares" que consumirá cinco anos, baseado apenas em suas crenças pessoais. Uau! Mas tudo bem, afinal, ela "escolheu acreditar".